141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_R0045 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_R0045  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0153561 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0043  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000110087  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt10  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt10  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0040  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.983411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2370  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00487087  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0062  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0049  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000210611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0059  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000205536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0057  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0056  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.661302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0026  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0067  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.38974  normal  0.157236 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0034  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14027  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0004  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna36  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0049  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  0.991667 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0073  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0005  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0046  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0026  tRNA-Gly  88.52 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.768519  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00109047  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0025  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0957376  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0034  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.530843  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0031  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.577391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0031  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.754836  normal  0.341264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0035  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.072829  normal  0.169297 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0025  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.896099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0031  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0030  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0043  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0056  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126363  hitchhiker  0.0000037028 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11940  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0048  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0048  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0035  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.987391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0036  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.048485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555629  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3118  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0033  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.544366 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1514  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0267785  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0008  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0353733  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0024  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0781725  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0744  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2577  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3055  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379519  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3090  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20543  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2036  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0005  tRNA-Gly  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000162881  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0061  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.944304  normal  0.76215 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.458906 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.633427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0003  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0027  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt05  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt05  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0001  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0003  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0045  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0032  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000435638  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0071  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000447795  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0032  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000507298  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0071  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000022788  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0054  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.809782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0030  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000137956  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1135  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276183  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0047  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0122655  normal  0.0125348 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0023  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000259024  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0039  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372449  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1005  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000280162  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09500  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0021  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0034  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000457466  normal  0.978086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0018  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00399522  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0005  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000107449  hitchhiker  0.00000669742 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0309  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0004  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159928  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS01509  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0065  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0043  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000310239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0046  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.837906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0003  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.856118  normal  0.0346282 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0021  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000145093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0088  tRNA-Gly  90 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0064  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0086  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795168  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0081  tRNA-Gly  90 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0459508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0052  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000802106  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0014  tRNA-Gly  89.74 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000379014  normal  0.408699 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0060  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0048  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0015  tRNA-Gly  89.74 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.685184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4794  tRNA-Gly  83.1 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>