251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_AR0005 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_AR0005  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0046  tRNA-Gly  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0027  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0061  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.944304  normal  0.76215 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555629  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0025  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.458906 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3118  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1514  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0267785  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0008  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0353733  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0025  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0024  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0781725  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0025  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.633427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0744  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2577  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3055  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379519  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3090  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20543  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2036  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0033  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.544366 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0046  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.837906  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS01509  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0065  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0003  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.856118  normal  0.0346282 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0004  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0007  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289353  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4794  tRNA-Gly  92 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60400  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 71 bp  87.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.589657  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0034  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54840  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 71 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000068368  unclonable  1.75195e-22 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0022  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.928948 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0048  tRNA-Gly  95.83 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna36  tRNA-Gly  95.83 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0073  tRNA-Gly  95.83 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0025  tRNA-Gly  94.23 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.896099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0048  tRNA-Gly  95.83 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0013  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000181775  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0048  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0007  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000568475  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0089  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00198921  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0007  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000140906  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4287  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.14711e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2801  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000458752  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0082  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000798848  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0007  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000313428  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0035  tRNA-Gly  95.45 
 
 		 71 bp  71.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.987391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0043  tRNA-Gly  95.24 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000310239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0003  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0047  tRNA-Gly  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0045  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 71 bp  65.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0153561 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0110  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 71 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0020  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0040  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.983411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1121t  tRNA-OTHER  89.29 
 
 		 69 bp  63.9  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2370  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00487087  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00076  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000423625  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4476  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000038079  hitchhiker  0.00000000000000785716 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0092  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000154336  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4719  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.20782e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4550  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000345033  hitchhiker  0.00000000000121992 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0030  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0538391 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5443  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000114766  hitchhiker  0.00132893 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4386  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000113588  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1180  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000995593  hitchhiker  0.000000000000787361 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0107  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000460652  hitchhiker  0.00217641 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4426  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000739048  hitchhiker  0.0000476038 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna007  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0698  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00121364  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5102  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000061566  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2721  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000223193  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGly01  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588593  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0001  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0028  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0490  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.826084  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4473  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0000778472  hitchhiker  0.000364054 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0005  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000491266  normal  0.390681 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0013  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000000316853  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna050  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000672543  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4695  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  5.29308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4354  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000304012  normal  0.98071 
 
 
-
 
NC_006368  lppt10  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt10  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06159  tRNA-Gly  87.1 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00235  tRNA-Gly  87.1 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0043  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000110087  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0021  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000145093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0012  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0021  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0026  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0060  tRNA-Gly  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1005  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000280162  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1135  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0092  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000423712  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0056  tRNA-Gly  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126363  hitchhiker  0.0000037028 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R23  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4305  tRNA-Gly  89.36 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02828  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0024  tRNA-Gly  89.36 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>