227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_R0021 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_R0021  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0025  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0048  tRNA-Gly  93.44 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0046  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0044  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0042  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0039  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0044  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0032  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0054  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0001  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0149399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0008  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.612025 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0046  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000127996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0045  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.102714  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0015  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000158444  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0004  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0061  tRNA-Gly  93.62 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.944304  normal  0.76215 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.951593  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  93.62 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555629  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0026  tRNA-Gly  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0025  tRNA-Gly  93.62 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.458906 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3118  tRNA-Gly  93.62 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0047  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1514  tRNA-Gly  93.62 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0267785  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0008  tRNA-Gly  93.62 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0353733  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0003  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0025  tRNA-Gly  93.62 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0024  tRNA-Gly  93.62 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0781725  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19030  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0744  tRNA-Gly  93.62 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0025  tRNA-Gly  93.62 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.633427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2577  tRNA-Gly  93.62 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3055  tRNA-Gly  93.62 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379519  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3090  tRNA-Gly  93.62 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20543  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2036  tRNA-Gly  93.62 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna36  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0073  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0030  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.218808 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0004  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0046  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.837906  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS01509  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0005  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0052  tRNA-Gly  96.97 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000802106  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0048  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0027  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0086  tRNA-Gly  96.97 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795168  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0065  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0021  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000145093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0003  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.856118  normal  0.0346282 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0046  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0048  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0003  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0064  tRNA-Gly  96.97 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0034  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0033  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.228268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0046  tRNA-Gly  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316882 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0043  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000110087  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0033  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.544366 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0110  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0032  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.274432  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0024  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1371  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.579151 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0044  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.69312  normal  0.302799 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0045  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0153561 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0046  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0027  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000174629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0040  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471615  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0019  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0015  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 67 bp  54  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0082796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0026  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0081  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0459508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0088  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0035  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.987391  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt05  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt10  tRNA-Gly  91.11 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt05  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0035  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144039  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0040  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0054  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.809782  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0022  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0368562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0001  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0035  tRNA-Gly  86.79 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0032  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0047  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0323697  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0012  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0022  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.928948 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0030  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000137956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0043  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0072  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0211705  normal  0.918041 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0032  tRNA-Gly  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000435638  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0071  tRNA-Gly  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000447795  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0077  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000000693473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0032  tRNA-Gly  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000507298  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0071  tRNA-Gly  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000022788  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0017  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0040  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.983411  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>