239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_R0024 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_R0024  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0017  tRNA-Gly  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.308145  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0035  tRNA-Gly  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0017  tRNA-Gly  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0047  tRNA-Gly  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0323697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0040  tRNA-Gly  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0043  tRNA-Gly  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0049  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000536409  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0046  tRNA-Gly  90.62 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0014  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000685902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0037  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000929008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0052  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0040  tRNA-Gly  95.56 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.346214  normal  0.248839 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0003  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160282  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlyVIMSS1309271  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.453566  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_757  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0984996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0096  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000621353  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0001  tRNA-Gly  88.52 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0149399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0038  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0043  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.530353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0002  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.367155  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0033  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.228268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0026  tRNA-Gly  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0045  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t23  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0001  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0018  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0048  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0035  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.801401  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0055  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930206  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0001  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0024  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.854506  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0010  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25240  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0007  tRNA-Gly  87.93 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.864337  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0004  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.017851 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0034  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0263488  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0008  tRNA-Gly  87.93 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.612025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0028  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309207  tRNA-Gly  87.93 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0040  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309383  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120568 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2515  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0285567  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2525  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000865266  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2628  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2219  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000214695  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2229  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2314  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  89.58 
 
 		 67 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28400  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0941347 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0021  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0036  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0022  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0368562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0044  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0048  tRNA-Gly  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0061  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0005  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0048  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0106217  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0032  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0002  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00924229  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0004  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0263126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0004  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0062  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0011  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0048  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863907  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000134783  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0039  tRNA-OTHER  89.36 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.022052  normal  0.0225653 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0024  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000390894  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0021  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0019  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.739612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0044  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0046  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0003  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0032  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_639  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000240622  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0045  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.102714  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0028  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0044  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0042  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0039  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0027  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133114  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0032  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.274432  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0015  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000158444  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0002  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0014  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298802  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0018  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2192  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000563667  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2232  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000000940116  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0012  tRNA-Gly  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000602687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0806  hypothetical protein  88.89 
 
 		 108 bp  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000935428 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0009  tRNA-Gly  85.96 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000199446  normal  0.87079 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0045  tRNA-Asp  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.316389 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0017  tRNA-Asp  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0066  tRNA-Gly  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000558399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>