159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_R0002 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_R0002  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00924229  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0055  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0003  tRNA-Gly  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0010  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0048  tRNA-Gly  94.92 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0048  tRNA-Gly  94.92 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0106217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0096  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000621353  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0030  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0003  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160282  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0005  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0039  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.936837  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0002  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.367155  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0015  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000158444  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0056  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0002  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.14234  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0021  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000904393  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0008  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0039  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0021  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0028  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0078  tRNA-Gly  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0024  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000390894  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11950  tRNA-Gly  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000172827  normal  0.0993064 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07190  tRNA-Gly  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.886703 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11980  tRNA-Gly  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000114191  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0017  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0016  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0011  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446743  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0046  tRNA-Gly  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0761072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0024  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4556  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2192  tRNA-Gly  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000563667  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2232  tRNA-Gly  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000000940116  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0003  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0003  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.564977  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0024  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0037  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.434121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0005  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0054  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0271354  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0042  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0065  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000604165  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0008  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0007  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09060  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0250104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA4  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489059 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0046  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0045  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.102714  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0026  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.223483  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0058  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0027  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000174629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0021  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101366  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4576  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0048  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0044  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.69312  normal  0.302799 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0018  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0057  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0029  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000023442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.369409  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0015  tRNA-Gly  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5531599999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0049  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000536409  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0003  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0051  tRNA-Gly  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1327  tRNA-Gly  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0266697  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0009  tRNA-Gly  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0539709  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0028  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0040  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0631602  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1718  tRNA-Gly  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000351586  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0050  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0034  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1467  tRNA-Gly  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000429546  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0094  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000022711  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0105  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.904682  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0017  tRNA-Gly  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000311098  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0003  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0003  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000134783  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt18  tRNA-Gly  88.64 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0018  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.746026  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4305  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0049  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0063  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0049  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0009  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0039  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.433295  normal  0.207379 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0022  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0012  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.286348 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0014  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298802  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0010  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0035  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0020  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.539056  normal  0.0659603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0045  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.804977  normal  0.403713 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0048  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0048  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna36  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0030  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0073  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>