201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_R0007 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_R0007  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.864337  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309207  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309383  tRNA-Gly  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0032  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0046  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0044  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0042  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0044  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0039  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0008  tRNA-Gly  97.92 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.612025 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlyVIMSS1309271  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0045  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0001  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0022  tRNA-Gly  95.65 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0368562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0003  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760714  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26280  tRNA-Gly  95.45 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0059  tRNA-Gly  95.45 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0025  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  95.24 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0004  tRNA-Gly  95.24 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.017851 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0077  tRNA-Gly  95.24 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000000693473  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0001  tRNA-Gly  95.24 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0067  tRNA-Gly  95.24 
 
 		 71 bp  67.9  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.294367 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25240  tRNA-Gly  95.24 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0032  tRNA-Gly  95.24 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.274432  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  95.24 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0057  tRNA-Gly  95.24 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0029  tRNA-Gly  95.12 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0035  tRNA-Gly  95.12 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0128  tRNA-Gly  95.12 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.521408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0017  tRNA-Gly  95.12 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.77032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0051  tRNA-Gly  95.12 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.637651  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0090  tRNA-Gly  95.12 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0079  tRNA-Gly  95.12 
 
 		 71 bp  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.926442  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0001  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0149399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0003  tRNA-Gly  95 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0031  tRNA-Gly  95 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0030  tRNA-Gly  95 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0538391 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0003  tRNA-Gly  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0033  tRNA-Gly  95 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0055  tRNA-Gly  95 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.273578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0060  tRNA-Gly  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0013  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218787  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt10  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt10  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0055  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0057  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0080  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0017  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000450697  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07725  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0092  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000423712  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0026  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0004  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0263126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0062  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35500  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0059  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.000543343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0011  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0024  tRNA-Gly  87.93 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0004  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0023  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0002    92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462188  normal  0.531526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0058  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0014  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0073  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0022  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0004  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0035  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.812042  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA7  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151828 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0003  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0029  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000023442  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0024  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0053  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0063  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0020  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00132609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0040  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4211  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1135  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276183  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1005  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000280162  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3852  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0011  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0047  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.951593  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0004  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0004  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699145  normal  0.0309415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0007  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00254544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0028  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0110  tRNA-Gly  90.7 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0004  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786418  normal  0.400526 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0058  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00122195  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0001  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.508752  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14004  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.308145  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0036  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.048485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0017  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38700  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0011  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000624107  normal  0.164759 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0047  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0323697  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0027  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0017  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0002  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>