229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38700 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_38700  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0013  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0057  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0004  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0004  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0263126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0058  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00122195  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0004  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0067  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 71 bp  109  9.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.294367 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0004  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699145  normal  0.0309415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0007  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00254544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0004  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786418  normal  0.400526 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0001  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.508752  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0060  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35500  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0047  tRNA-Gly  94.29 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14004  tRNA-Gly  94.29 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0080  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0011  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0062  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0001  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0004  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.017851 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0002  tRNA-Gly  92.65 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0059  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.000543343  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25240  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0105  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0059  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0057  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0077  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000000693473  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26280  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1005  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000280162  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1135  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276183  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09150  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0613367 
 
 
-
 
NC_006368  lppt10  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt10  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0007  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0005  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.582473  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0049  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  0.991667 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0029  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000023442  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0035  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.812042  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0016  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000070019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0006  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 66 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.926314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0055  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0079  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.926442  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00109047  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.951593  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt05  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt05  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0051  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.637651  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0045  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0957385  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0039  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0054  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.809782  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0020  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00132609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2370  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00487087  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4556  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0036  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.048485  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0024  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0090  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0017  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000450697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0040  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.983411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0030  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000137956  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0003  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.564977  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0017  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.77032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12430  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0128  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.521408 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0040  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0008  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.612025 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0028  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0002  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0003  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0003  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0053  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0023  tRNA-Gly  85.51 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0002  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.367155  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0025  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.351803  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0150  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000645582  hitchhiker  0.00000000139269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0041  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.771709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0154  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000693037  hitchhiker  0.000107525 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0011  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511847  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0015  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000000368729  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0008  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000140314  normal  0.0304222 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0053  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000571258  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0003  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0043  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000110087  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R23  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0065  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0051  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0063  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0053  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0057  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0051  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna5  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627053  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0036  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.828148  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60030  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0820  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0945604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0096  tRNA-Gly  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000621353  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0068  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>