More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_R0017 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_R0017  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000450697  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0092  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 71 bp  109  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000423712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0110  tRNA-Gly  92.96 
 
 		 71 bp  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0052  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000802106  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0064  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0086  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795168  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0081  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0459508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0088  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0001  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0059  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0077  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000000693473  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0004  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.017851 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0011  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0071  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000447795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0032  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000435638  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0032  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000507298  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0071  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000022788  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0013  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0026  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25240  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt10  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt10  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1135  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276183  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0006  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0005  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0030  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000875234  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1005  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000280162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5686  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000717996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5710  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000586267  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0296207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228413  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  2.7190299999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000386935  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0004  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0263126  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000014568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00371423  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0029  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000023442  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0060  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0002  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0545  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3943e-45 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0030  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000137956  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0637  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000118673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0619  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.152759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4757  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000781489  hitchhiker  6.01027e-18 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000188578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000146044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0117  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000414108  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26280  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0121  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000324083  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0004  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0062  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0024  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4567  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0032  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.274432  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0003  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0054  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.809782  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0002  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4618  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000037531  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0011  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000624107  normal  0.164759 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0089  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140643  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5721  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5794  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0093  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778252  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0028  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0229  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000723342  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5666  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000047392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5715  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.201708  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.881169  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0053  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000226275  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000161522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00298104  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508685  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000206575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4986  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000743602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0660742  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5802  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00821355  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0025  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0126  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.876495  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0122  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0177171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0279  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5042  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0301  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000859433  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0037  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0084  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5017  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00202999  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5674  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0053  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000840189  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt05  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt05  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0051  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.637651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>