238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_R0007 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_R0058  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00122195  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0004  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0004  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699145  normal  0.0309415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0007  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00254544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0001  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.508752  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0004  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786418  normal  0.400526 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14004  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  145  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0047  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0060  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38700  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0013  tRNA-Gly  94.2 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0057  tRNA-Gly  92.96 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0059  tRNA-Gly  92.75 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26280  tRNA-Gly  92.75 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0011  tRNA-Gly  92.75 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 66 bp  95.6  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.926314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0080  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35500  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0004  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0263126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0062  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0004  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0067  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 71 bp  87.7  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.294367 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0005  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.582473  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0002  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0001  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0035  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.812042  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0004  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.017851 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25240  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0063  tRNA-Gly  91.38 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0003  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.564977  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0051  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.637651  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0023  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0059  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  73.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.000543343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0020  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00132609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4556  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0077  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000000693473  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0003  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0128  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.521408 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0040  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0017  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.77032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0090  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt10  tRNA-Gly  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt10  tRNA-Gly  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0007  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0024  tRNA-Gly  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0002    90.91 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462188  normal  0.531526 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0014  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0073  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0022  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0004  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0058  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0003  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA7  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151828 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0030  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000137956  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0030  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0538391 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09150  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0613367 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0003  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0031  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2154  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.480765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2514  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0272965  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2521  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000668115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2524  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000475976  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2532  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101375  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2620  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0852955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2627  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2629  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1865  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2218  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000193879  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2225  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000670564  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2228  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000002233  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2306  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000790544  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2313  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2315  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0033  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0055  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.273578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0002  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0003  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0054  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.809782  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1005  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000280162  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1135  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276183  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0079  tRNA-Gly  88.33 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.926442  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R32  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t22  tRNA-Gly  90.2 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4566  tRNA-Gly  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.778703  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0035  tRNA-Gly  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0017  tRNA-Gly  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0039  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1214  tRNA-Gly  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0061  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0017  tRNA-Gly  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0018  tRNA-Gly  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.395535  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0059  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0045  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0957385  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0055  tRNA-Gly  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0003  tRNA-Gly  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0040    85.51 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0038  tRNA-Gly  85.51 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0052  tRNA-Gly  85.51 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0161202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>