62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_R0005 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_R0005  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.582473  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35500  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0062  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0007  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0057  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0080  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0004  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0001  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.508752  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0004  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786418  normal  0.400526 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0004  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699145  normal  0.0309415 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0058  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00122195  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0007  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00254544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0028  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14004  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.951593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0011  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25240  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0004  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.017851 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38700  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0013  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0004  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0263126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09150  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0613367 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0029  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000023442  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0004  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0067  tRNA-Gly  88.33 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.294367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0060  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0047  tRNA-Gly  87.1 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0055  tRNA-Gly  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 66 bp  58  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.926314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0057  tRNA-Gly  85.51 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0057  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0036  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.828148  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt10  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt10  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0063  tRNA-Gly  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0041  tRNA-Gly  84.29 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.771709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0039  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0045  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0957385  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12430  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0051  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt05  tRNA-Gly  84.06 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt05  tRNA-Gly  84.06 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0077  tRNA-Gly  84.06 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000000693473  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0032  tRNA-Gly  84.06 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0043  tRNA-Gly  85 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11456  normal  0.782815 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0016  tRNA-Gly  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0059  tRNA-Gly  85 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.000543343  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0025  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.351803  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0002  tRNA-Gly  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.367155  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0035  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.812042  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0040  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0002  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0004  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.382329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0003  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0180  tRNA-Gly  83.87 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0303819  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0036  tRNA-Gly  83.87 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2565  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0020  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00132609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0065  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19030  tRNA-Gly  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09840  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0598581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>