73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_t2565 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_t2565  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt01  tRNA-His  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0092  tRNA-His  88.41 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-His-1  tRNA-His  88.89 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.8842  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-His-2  tRNA-His  88.89 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0650  tRNA-His  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0080  tRNA-His  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0289577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0107  tRNA-His  88.46 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.576525  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0048  tRNA-His  88.46 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0087  tRNA-His  88.46 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4767  tRNA-His  85.71 
 
 		 78 bp  54  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000106847  hitchhiker  8.57127e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5001  tRNA-His  85.71 
 
 		 78 bp  54  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0535  tRNA-His  85.71 
 
 		 78 bp  54  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07108e-31 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5681  tRNA-His  85.71 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00674866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0214  tRNA-His  85.71 
 
 		 78 bp  54  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5817  tRNA-His  85.71 
 
 		 78 bp  54  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000694475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5716  tRNA-His  85.71 
 
 		 78 bp  54  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00269578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5032  tRNA-His  85.71 
 
 		 78 bp  54  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0610  tRNA-His  85.71 
 
 		 78 bp  54  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893119  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0141  tRNA-His  85.71 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000990259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-His-2  tRNA-His  85.71 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000329782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-His-1  tRNA-His  85.71 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000556995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-His-2  tRNA-His  85.71 
 
 		 79 bp  54  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000115828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-His-1  tRNA-His  85.71 
 
 		 79 bp  54  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00869037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-His-2  tRNA-His  85.71 
 
 		 79 bp  54  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0207429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-His-1  tRNA-His  85.71 
 
 		 79 bp  54  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047518  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-His-2  tRNA-His  85.71 
 
 		 79 bp  54  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000344538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-His-1  tRNA-His  85.71 
 
 		 79 bp  54  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000104499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5730  tRNA-His  85.71 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0137  tRNA-His  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000594746  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0084  tRNA-His  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624791  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0057  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0039  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.351803  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35500  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0060  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0080  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0087  tRNA-His  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.98508e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0051  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0045  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0957385  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0041  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.771709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38700  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09840  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0598581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0088  tRNA-His  84.13 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0130183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0033  tRNA-His  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000862189  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0044  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.363029  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0004  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0033  tRNA-His  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000464813  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0038  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499148  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0058  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00122195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0042  tRNA-His  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.771364  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0040  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0861757  normal  0.0439849 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0034  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0037  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14032  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000156026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0005  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.582473  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0020  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.748277  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0023  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14004  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0043  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0622835 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0051  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0002  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.367155  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0017  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0817161  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1593  tRNA-His  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000819622  normal  0.473468 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0042  tRNA-His  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0001  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.508752  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0004  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699145  normal  0.0309415 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0016  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 66 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.926314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0007  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00254544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0020  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0004  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786418  normal  0.400526 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0016  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>