44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_R0033 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_R0033  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000862189  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0033  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000464813  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0042  tRNA-His  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.771364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0042  tRNA-His  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-His-1  tRNA-His  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-His-2  tRNA-His  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0214  tRNA-His  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4767  tRNA-His  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000106847  hitchhiker  8.57127e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5817  tRNA-His  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000694475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5716  tRNA-His  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00269578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5032  tRNA-His  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0610  tRNA-His  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0535  tRNA-His  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07108e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5001  tRNA-His  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-His-2  tRNA-His  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000329782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-His-1  tRNA-His  88.16 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047518  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5730  tRNA-His  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-His-1  tRNA-His  88.16 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000104499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-His-2  tRNA-His  88.16 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000344538  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-His-2  tRNA-His  88.16 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0207429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-His-1  tRNA-His  88.16 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00869037  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-His-2  tRNA-His  88.16 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000115828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5681  tRNA-His  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00674866  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-His-1  tRNA-His  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000556995  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-His-2  tRNA-His  91.53 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-His-1  tRNA-His  91.53 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.8842  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0092  tRNA-His  92.59 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0088  tRNA-His  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0130183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0084  tRNA-His  87.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0137  tRNA-His  87.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000594746  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1827  tRNA-His  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.148729  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt01  tRNA-His  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0650  tRNA-His  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1593  tRNA-His  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000819622  normal  0.473468 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0141  tRNA-His  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000990259  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R03  tRNA-His  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.890887  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0013  tRNA-His  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0132722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0087  tRNA-His  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.98508e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0038  tRNA-His  88.64 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0027  tRNA-His  88.64 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0053  tRNA-Gln  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000118291 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0038  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000125713  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2565  tRNA-His  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0004  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0165875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>