52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_R0013 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_R0013  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0132722  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0038  tRNA-His  95.89 
 
 
73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0027  tRNA-His  95.89 
 
 
73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0001  tRNA-His  94.52 
 
 
73 bp  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691209  normal  0.382494 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0034  tRNA-His  95.65 
 
 
73 bp  113  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144339  normal  0.0310402 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0043  tRNA-His  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0045  tRNA-His  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.169896 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0036  tRNA-His  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.34645  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAHisVIMSS1309099  tRNA-His  91.3 
 
 
73 bp  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAHisVIMSS1309297  tRNA-His  89.86 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105395 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAHisVIMSS1309172  tRNA-His  89.86 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAHisVIMSS1309211  tRNA-His  92.98 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAHisVIMSS1309381  tRNA-His  89.86 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0033  tRNA-His  89.86 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0029  tRNA-His  89.86 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0024  tRNA-His  92.98 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0015  tRNA-His  92.98 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0033  tRNA-Gln  93.1 
 
 
75 bp  75.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAHisVIMSS1309131  tRNA-His  88.41 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.487873  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0012  tRNA-Gln  92.59 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12185  normal  0.483393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA16  tRNA-Gln  90.74 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0016  tRNA-Gln  90.74 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194756  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-His-2  tRNA-His  88.24 
 
 
73 bp  54  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-His-1  tRNA-His  88.24 
 
 
76 bp  54  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0042  tRNA-His  89.13 
 
 
73 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.771364  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0033  tRNA-His  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000862189  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0042  tRNA-His  89.13 
 
 
73 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0033  tRNA-His  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000464813  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0037  tRNA-Gln  96.55 
 
 
72 bp  50.1  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0225857  normal  0.764291 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0092  tRNA-His  85.25 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19911  hypothetical protein  91.67 
 
 
267 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.110638 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0012  tRNA-Gln  88.46 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.376695  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0754  tRNA-Gln  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0036  tRNA-Gln  89.74 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0040  tRNA-Gln  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0806807  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0014  tRNA-Gln  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0148623  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0005  tRNA-Gln  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1503  tRNA-Gln  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000219076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0570  tRNA-Gln  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000532927  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0005  tRNA-Gln  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.460384  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0586  tRNA-Gln  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.228924  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2931  tRNA-Gln  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000617655  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0087  tRNA-Gln  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03325  tRNA-Gln  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000226692  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0019    87.04 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255939  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0023  tRNA-Gln  87.04 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0444305  normal  0.71139 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4327  tRNA-Gln  87.04 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0037  tRNA-Gln  85.19 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0014  tRNA-Gln  87.04 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.349887  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0022  tRNA-Gln  87.04 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0021  tRNA-Gln  87.04 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0591367 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>