43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_R0087 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_R0087  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.98508e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0141  tRNA-His  96.72 
 
 
76 bp  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000990259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0088  tRNA-His  95.08 
 
 
76 bp  97.6  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0130183  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-His-1  tRNA-His  96.3 
 
 
79 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000104499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5681  tRNA-His  96.3 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00674866  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0610  tRNA-His  96.3 
 
 
78 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5032  tRNA-His  96.3 
 
 
78 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540758  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5716  tRNA-His  96.3 
 
 
78 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00269578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5817  tRNA-His  96.3 
 
 
78 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000694475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0214  tRNA-His  96.3 
 
 
78 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183126  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4767  tRNA-His  96.3 
 
 
78 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000106847  hitchhiker  8.57127e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0535  tRNA-His  96.3 
 
 
78 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07108e-31 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-His-2  tRNA-His  96.3 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000329782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-His-1  tRNA-His  96.3 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000556995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5001  tRNA-His  96.3 
 
 
78 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-His-2  tRNA-His  96.3 
 
 
79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000115828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-His-1  tRNA-His  96.3 
 
 
79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00869037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-His-2  tRNA-His  96.3 
 
 
79 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0207429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-His-1  tRNA-His  96.3 
 
 
79 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047518  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-His-2  tRNA-His  96.3 
 
 
79 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000344538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5730  tRNA-His  96.3 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0084  tRNA-His  96.08 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0137  tRNA-His  96.08 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000594746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-His-2  tRNA-His  92.59 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-His-1  tRNA-His  92.59 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0078  tRNA-His  95 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0087  tRNA-His  94.74 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0048  tRNA-His  94.74 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0107  tRNA-His  94.74 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.576525  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0080  tRNA-His  94.74 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0289577  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R03  tRNA-His  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.890887  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0027  tRNA-His  88.24 
 
 
73 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0092  tRNA-His  85.71 
 
 
73 bp  54  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0038  tRNA-His  88.24 
 
 
73 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0034  tRNA-His  87.04 
 
 
73 bp  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144339  normal  0.0310402 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0033  tRNA-His  87.04 
 
 
76 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000464813  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0033  tRNA-His  87.04 
 
 
76 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000862189  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2565  tRNA-His  84.62 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13120  tRNA-His  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.100259  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0042  tRNA-His  86.27 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0042  tRNA-His  86.27 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.771364  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1593  tRNA-His  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000819622  normal  0.473468 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0051  tRNA-His  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000083549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>