26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_R0034 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_R0034  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144339  normal  0.0310402 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0001  tRNA-His  95.65 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691209  normal  0.382494 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0013  tRNA-His  95.65 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0132722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0027  tRNA-His  94.2 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0038  tRNA-His  94.2 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0043  tRNA-His  92.75 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0036  tRNA-His  92.75 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.34645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0045  tRNA-His  89.86 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.169896 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAHisVIMSS1309099  tRNA-His  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAHisVIMSS1309131  tRNA-His  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.487873  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0033  tRNA-His  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAHisVIMSS1309297  tRNA-His  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105395 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAHisVIMSS1309172  tRNA-His  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAHisVIMSS1309381  tRNA-His  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0029  tRNA-His  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAHisVIMSS1309211  tRNA-His  86.36 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0015  tRNA-His  86.36 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0024  tRNA-His  86.36 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0033  tRNA-Gln  88.33 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0012  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12185  normal  0.483393 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0087  tRNA-His  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.98508e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0050  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA16  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0016  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0026  tRNA-Gln  89.13 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327686  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0019    87.04 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255939  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>