55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_R0088 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_R0088  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0130183  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-His-1  tRNA-His  98.68 
 
 		 79 bp  143  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00869037  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0214  tRNA-His  98.68 
 
 		 78 bp  143  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4767  tRNA-His  98.68 
 
 		 78 bp  143  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000106847  hitchhiker  8.57127e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0535  tRNA-His  98.68 
 
 		 78 bp  143  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07108e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5001  tRNA-His  98.68 
 
 		 78 bp  143  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5817  tRNA-His  98.68 
 
 		 78 bp  143  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000694475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5716  tRNA-His  98.68 
 
 		 78 bp  143  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00269578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-His-2  tRNA-His  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000329782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-His-1  tRNA-His  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000556995  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5032  tRNA-His  98.68 
 
 		 78 bp  143  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540758  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-His-2  tRNA-His  98.68 
 
 		 79 bp  143  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000115828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-His-2  tRNA-His  98.68 
 
 		 79 bp  143  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0207429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-His-1  tRNA-His  98.68 
 
 		 79 bp  143  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047518  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-His-2  tRNA-His  98.68 
 
 		 79 bp  143  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000344538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-His-1  tRNA-His  98.68 
 
 		 79 bp  143  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000104499  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0610  tRNA-His  98.68 
 
 		 78 bp  143  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893119  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0141  tRNA-His  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000990259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5730  tRNA-His  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5681  tRNA-His  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00674866  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0084  tRNA-His  98.59 
 
 		 76 bp  133  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0137  tRNA-His  98.59 
 
 		 76 bp  133  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000594746  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0087  tRNA-His  95.08 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.98508e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0080  tRNA-His  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0289577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0107  tRNA-His  90.91 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.576525  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0048  tRNA-His  90.91 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0087  tRNA-His  90.91 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R03  tRNA-His  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.890887  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-His-1  tRNA-His  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0078  tRNA-His  88.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-His-2  tRNA-His  90.48 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-His-1  tRNA-His  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.8842  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-His-2  tRNA-His  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0033  tRNA-His  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000862189  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0033  tRNA-His  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000464813  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0038  tRNA-His  90.74 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0027  tRNA-His  90.74 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0042  tRNA-His  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1593  tRNA-His  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000819622  normal  0.473468 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0042  tRNA-His  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.771364  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0092  tRNA-His  85.29 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0024  tRNA-His  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441767  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0020  tRNA-His  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.889352  normal  0.733975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0019  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0563192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2565  tRNA-His  84.13 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1762  tRNA-His  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0015  tRNA-His  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000558308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0087  tRNA-His  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0186  tRNA-His  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0001  tRNA-His  85.19 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691209  normal  0.382494 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0010  tRNA-His  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0197476  normal  0.604163 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0009  tRNA-His  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000796355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0045  tRNA-His  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000886239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2041  tRNA-His  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000147998  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-His-1  tRNA-His  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.34848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>