71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-His-1 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  tRNA-His-1  tRNA-His  100 
 
 
79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000104499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-His-2  tRNA-His  100 
 
 
79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000344538  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-His-1  tRNA-His  100 
 
 
79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047518  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-His-2  tRNA-His  100 
 
 
79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0207429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-His-1  tRNA-His  100 
 
 
79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00869037  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-His-2  tRNA-His  100 
 
 
79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000115828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0535  tRNA-His  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07108e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5001  tRNA-His  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4767  tRNA-His  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000106847  hitchhiker  8.57127e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0214  tRNA-His  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183126  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5817  tRNA-His  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000694475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5716  tRNA-His  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00269578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0610  tRNA-His  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5032  tRNA-His  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-His-1  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000556995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-His-2  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000329782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5730  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5681  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00674866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0088  tRNA-His  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0130183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0137  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  141  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000594746  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0084  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  141  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0141  tRNA-His  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000990259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0080  tRNA-His  92.75 
 
 
76 bp  97.6  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0289577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0048  tRNA-His  92.42 
 
 
73 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0107  tRNA-His  92.42 
 
 
73 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.576525  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0087  tRNA-His  92.42 
 
 
73 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0087  tRNA-His  96.3 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.98508e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-His-1  tRNA-His  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R03  tRNA-His  93.33 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.890887  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-His-2  tRNA-His  92.06 
 
 
73 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0078  tRNA-His  90.14 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-His-1  tRNA-His  89.04 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.8842  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-His-2  tRNA-His  89.04 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0033  tRNA-His  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000464813  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0033  tRNA-His  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000862189  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1593  tRNA-His  90.57 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000819622  normal  0.473468 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0042  tRNA-His  86.3 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0042  tRNA-His  86.3 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.771364  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0092  tRNA-His  86.76 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0027  tRNA-His  88.89 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0038  tRNA-His  88.89 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2565  tRNA-His  85.71 
 
 
73 bp  54  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0001  tRNA-His  87.04 
 
 
73 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691209  normal  0.382494 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0009  tRNA-His  96.67 
 
 
76 bp  52  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000796355  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0010  tRNA-His  96.67 
 
 
76 bp  52  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0197476  normal  0.604163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0036  tRNA-His  87.04 
 
 
73 bp  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.34645  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0045  tRNA-His  96.67 
 
 
76 bp  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000886239  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0070  tRNA-His  87.76 
 
 
75 bp  50.1  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0064  tRNA-His  90.24 
 
 
75 bp  50.1  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000223288  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0007  tRNA-His  87.76 
 
 
75 bp  50.1  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831661  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt01  tRNA-His  85.96 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0063  tRNA-His  90.24 
 
 
75 bp  50.1  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000214057  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0024  tRNA-His  90 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441767  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0018  tRNA-His  90 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.898186  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0040  tRNA-His  88.37 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.262855 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60220  tRNA-His  88.37 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41330  tRNA-His  88.37 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.908879  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1827  tRNA-His  84.75 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.148729  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3503  tRNA-His  88.37 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3505  tRNA-His  88.37 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2136  tRNA-His  93.55 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00922633  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2211  tRNA-His  93.55 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240288  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0054  tRNA-His  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0019  tRNA-His  86 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.248393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0018  tRNA-His  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.338609  normal  0.373467 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0022  tRNA-His  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119754  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0035  tRNA-His  89.47 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246336  normal  0.0312371 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1684  tRNA-His  93.33 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.592978  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0020  tRNA-His  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.889352  normal  0.733975 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0045  tRNA-His  89.47 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.169896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0069  tRNA-Gln  88.1 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>