71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_R03 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_R03  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.890887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-His-1  tRNA-His  93.33 
 
 
79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00869037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5817  tRNA-His  93.33 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000694475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0214  tRNA-His  93.33 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183126  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4767  tRNA-His  93.33 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000106847  hitchhiker  8.57127e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0535  tRNA-His  93.33 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07108e-31 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-His-2  tRNA-His  93.33 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000329782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-His-1  tRNA-His  93.33 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000556995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5001  tRNA-His  93.33 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5716  tRNA-His  93.33 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00269578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5032  tRNA-His  93.33 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0610  tRNA-His  93.33 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893119  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-His-2  tRNA-His  93.33 
 
 
79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000115828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-His-2  tRNA-His  93.33 
 
 
79 bp  87.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0207429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-His-1  tRNA-His  93.33 
 
 
79 bp  87.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047518  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-His-2  tRNA-His  93.33 
 
 
79 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000344538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-His-1  tRNA-His  93.33 
 
 
79 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000104499  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0137  tRNA-His  93.33 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000594746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5730  tRNA-His  93.33 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5681  tRNA-His  93.33 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00674866  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0084  tRNA-His  93.33 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0088  tRNA-His  91.67 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0130183  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-His-2  tRNA-His  91.23 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-His-1  tRNA-His  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0141  tRNA-His  90 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000990259  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-His-2  tRNA-His  90 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-His-1  tRNA-His  90 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.8842  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0080  tRNA-His  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0289577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0107  tRNA-His  89.47 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.576525  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0048  tRNA-His  89.47 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0087  tRNA-His  89.47 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt01  tRNA-His  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0650  tRNA-His  90.57 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0033  tRNA-His  88.68 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000464813  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0042  tRNA-His  88.68 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0033  tRNA-His  88.68 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000862189  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0042  tRNA-His  88.68 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.771364  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0092  tRNA-His  87.72 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0087  tRNA-His  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.98508e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1593  tRNA-His  86.79 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000819622  normal  0.473468 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0030  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0538391 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna36  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0035  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  44.1  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.987391  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0024  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0781725  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0073  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0008  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0353733  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0046  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1514  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0033  tRNA-Gly  100 
 
 
72 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.544366 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0034  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3118  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0005  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555629  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0012  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3090  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20543  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2036  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2577  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0744  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0023  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  44.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000259024  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0039  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  44.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372449  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0061  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.944304  normal  0.76215 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0003  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0043  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000310239  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.458906 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0048  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.633427  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0048  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0027  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3055  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379519  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0045  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  44.1  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0153561 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>