217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_R0035 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_R0035  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.987391  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00054  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0016  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3372  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 76 bp  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.564657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0066  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4154  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 76 bp  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0729117 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2997  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 76 bp  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0073  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.423139  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3267  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 76 bp  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3192  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 76 bp  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0018  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.268435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3205  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 76 bp  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.582072 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0078  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3271  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 76 bp  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3531  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 76 bp  109  8.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4697  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 76 bp  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00274412  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5067  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0043  tRNA-Gly  94.2 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000310239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0025  tRNA-Gly  93.06 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0030  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0538391 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0063  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0034  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3852  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0023  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.333471 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0011  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4211  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0002    90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462188  normal  0.531526 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0014  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0073  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0022  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0004  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0053  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0025  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.896099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0003  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA7  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0058  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0048  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna36  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0048  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0003  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0079  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.926442  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0073  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0031  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0053  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0033  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1005  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000280162  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0055  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.273578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1135  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276183  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0027  tRNA-Gly  95.45 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0005  tRNA-Gly  95.45 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0046  tRNA-Gly  95.45 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0003  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0003  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0040  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.983411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0043  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000110087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0020  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00132609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0001  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0128  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.521408 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0040  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0017  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.77032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2370  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00487087  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0051  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.637651  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0090  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0023  tRNA-Gly  87.69 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS01509  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555954  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555629  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0061  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.944304  normal  0.76215 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0046  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.837906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3118  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0033  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.544366 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1514  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0065  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0008  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0353733  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0025  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0024  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0781725  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0003  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.856118  normal  0.0346282 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0025  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.633427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0025  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.458906 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0744  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0004  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2577  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3055  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379519  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3090  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20543  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2036  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0045  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0153561 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0042  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0606601  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt10  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt10  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0060  tRNA-Gly  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0059  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0065  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0004  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.382329 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0029  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000023442  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0039  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372449  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0035  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.812042  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0110  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0024  tRNA-Gly  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0023  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000259024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>