273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B3192 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3267  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3192  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3271  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3205  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.582072 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2997  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3372  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.564657  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4154  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0729117 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4697  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00274412  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3531  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  149  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00054  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0016  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0073  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.423139  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5067  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0018  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.268435  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0078  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0066  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4211  tRNA-Gly  97.3 
 
 
74 bp  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0011  tRNA-Gly  97.3 
 
 
74 bp  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3852  tRNA-Gly  97.3 
 
 
74 bp  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA7  tRNA-Gly  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151828 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0002    94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462188  normal  0.531526 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0003  tRNA-Gly  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0014  tRNA-Gly  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0023  tRNA-Gly  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.333471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0073  tRNA-Gly  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0022  tRNA-Gly  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274402  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0004  tRNA-Gly  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0058  tRNA-Gly  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0035  tRNA-Gly  94.37 
 
 
71 bp  109  9.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.987391  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0090  tRNA-Gly  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0051  tRNA-Gly  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.637651  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0031  tRNA-Gly  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0003  tRNA-Gly  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0063  tRNA-Gly  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0128  tRNA-Gly  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.521408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0017  tRNA-Gly  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.77032  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0033  tRNA-Gly  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535197  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0055  tRNA-Gly  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.273578  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0023  tRNA-Gly  92.65 
 
 
74 bp  95.6  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0059  tRNA-Gly  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0020  tRNA-Gly  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00132609  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0040  tRNA-Gly  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610701  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0035  tRNA-Gly  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.812042  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0024  tRNA-Gly  91.18 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0025  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0053  tRNA-Gly  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0034  tRNA-Gly  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0030  tRNA-Gly  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0538391 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0053  tRNA-Gly  88.73 
 
 
71 bp  77.8  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0056  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126363  hitchhiker  0.0000037028 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0003  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0003  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.564977  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4556  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0025  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.896099  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4794  tRNA-Gly  93.88 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0043  tRNA-Gly  88.41 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000310239  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0079  tRNA-Gly  87.32 
 
 
71 bp  69.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.926442  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19030  tRNA-Gly  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0028  tRNA-Gly  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60400  tRNA-Gly  93.33 
 
 
71 bp  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.589657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54840  tRNA-Gly  93.33 
 
 
71 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000068368  unclonable  1.75195e-22 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0048  tRNA-Gly  91.67 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0007  tRNA-Gly  91.67 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289353  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2370  tRNA-Gly  85.33 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00487087  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0042  tRNA-Gly  85.92 
 
 
71 bp  61.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0606601  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0022  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.600355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0064  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0048  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0037  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26280  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0040    85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna36  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4305  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA37  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0779293 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0040  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.983411  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0065  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0028  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.721667  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0069  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.448955  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0010  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0052  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0161202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0055  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.3002  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0073  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0024  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663952  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0049  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0001  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0009  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256172  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0048  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0012  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.286348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0007  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0007  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0021  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.292095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0069  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024134  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0022  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0038  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0002  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0003  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0070  tRNA-Gly  92.68 
 
 
71 bp  58  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0869039  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0032  tRNA-Gly  92.5 
 
 
75 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0044  tRNA-Gly  92.5 
 
 
75 bp  56  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>