173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_R0042 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_R0042  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0606601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0023  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.333471 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00054  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0016  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2997  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3372  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.564657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0073  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.423139  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0018  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.268435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4154  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0729117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0002    85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462188  normal  0.531526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3267  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0059  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0014  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3531  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0073  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0063  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0022  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3271  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0004  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3205  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.582072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3192  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0003  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0035  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.987391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0078  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0066  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA7  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0058  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4697  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00274412  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5067  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0129  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0043  tRNA-Gly  85.51 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000310239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0054  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.290496  normal  0.747562 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt08  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.711822  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt09  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745225  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0058  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0060  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.766632 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4305  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0004  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.54255  normal  0.0153905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0055  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.9646 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0052  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.165358 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0005  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0069  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.448955  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0037  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0014  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.854137  normal  0.0928806 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0005  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118248  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0042  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0049  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0059  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.07343  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0009  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54840  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000068368  unclonable  1.75195e-22 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0045  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.471231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0052  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0060  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312952  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0063  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0061  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.638683  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0022  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60400  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.589657  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4576  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0012  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.286348 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0007  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0839  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.343418  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0959  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0010  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0046  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4794  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0024  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113773  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0060  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18005  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0007  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0015  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409791  hitchhiker  0.00133566 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0003  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1005  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000280162  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0033  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0055  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.273578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0034  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0031  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1135  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276183  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0011  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  2.9187400000000002e-24  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0006  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.328073  hitchhiker  0.00695117 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0004  tRNA-OTHER  91.3 
 
 		 67 bp  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0061  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0027  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0018  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.756582 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0048  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0825  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.364778  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0028  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0056  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126363  hitchhiker  0.0000037028 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0023  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185917  normal  0.670849 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0016  tRNA-Gly  84.72 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS05586  tRNA-Gly  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000136136  normal  0.200305 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3796  tRNA-Gly  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000000939303  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0021  tRNA-Gly  85 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000327134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0002  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0019  tRNA-Gly  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3086  tRNA-Gly  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0058  tRNA-Gly  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0024  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0060  tRNA-Gly  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000000611366  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0013  tRNA-Gly  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000164045  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0012  tRNA-Gly  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000183499  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0035  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0578114  normal  0.382636 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>