143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0129 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0129  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0042  tRNA-Gly  90 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0606601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0058  tRNA-Gly  88.33 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0060  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0063  tRNA-Gly  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10740  tRNA-Gly  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0089339  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0044  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0345012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0825  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.364778  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26280  tRNA-Gly  84.06 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0043  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0822724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0042  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0041  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna23  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna21  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0023  tRNA-Gly  84.38 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.021733  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0567  tRNA-Gly  84.38 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0066  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000867267  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04003  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000136534  normal  0.315468 
 
 
-
 
NC_003295  RS04004  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000000202158  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5654  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000615914  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5683  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0251422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5692  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000815905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5728  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000760665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000301735  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0043  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0285317  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000174679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00746864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000472811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.34208  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000445849  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000170652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000219047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000721816  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273307  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051021  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0495451  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0037  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0038  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0068  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00512241  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0021  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0839387  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2881  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2882  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0043  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00341468  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0045  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960605  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000594127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000064552  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1741  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0350949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1742  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0559851  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0045  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0047  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.686497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0056  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00797069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0057  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000972569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0040  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00614875  decreased coverage  0.00000263085 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0019  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0020  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0021  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.168076  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0035  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000173498  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0036  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000574217  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0037  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000566615  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0028  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000877648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0177  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0033  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100821  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0034  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.205379  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0035  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0039  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0037  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670203 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2826  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0217259  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2827  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0128974  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2766  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0786611  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2826  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2827  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1777  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00314954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0022  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00428299  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0040  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000910792  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0086  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0098  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00020662  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0049  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00162631  normal  0.347035 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0050  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00077941  normal  0.344918 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0051  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000327476  normal  0.339785 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0022  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110394  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0040  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.634702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0090  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0102  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000562923  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0139  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00889637  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0035  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0036  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0037  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0035  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0037  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.694382  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0035  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0036  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.279853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0037  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.211481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0039  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0035  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0590805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0036  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.19079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0038  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.351853 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>