63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_R0066 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_R0066  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000867267  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1604  tRNA-Gly  87.32 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.841854 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1569  tRNA-Gly  87.32 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0040  tRNA-Gly  88.89 
 
 
71 bp  63.9  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0084  tRNA-Gly  87.5 
 
 
71 bp  56  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0037  tRNA-Gly  87.5 
 
 
71 bp  56  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  87.5 
 
 
71 bp  56  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  87.5 
 
 
71 bp  56  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.881169  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  87.5 
 
 
71 bp  56  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0056  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  56  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268197  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA61  tRNA-Gly  92.11 
 
 
74 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0049  tRNA-Gly  84.72 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0173408  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0009  tRNA-Gly  84.72 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886976  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0073  tRNA-Gly  84.72 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611784  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0072  tRNA-Gly  84.72 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0044  tRNA-Gly  84.72 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00255441  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0016  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.598458 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0129  tRNA-Gly  87.5 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0029  tRNA-Gly  84.72 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.707259  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna21  tRNA-Gly  89.36 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0909  tRNA-Gly  89.36 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2331  tRNA-Gly  89.36 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0152091  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  89.36 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.611211  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2253  tRNA-Gly  89.36 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna23  tRNA-Gly  89.36 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0024  tRNA-Gly  89.36 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0025  tRNA-Gly  89.36 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0020  tRNA-Gly  89.36 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286535 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0041  tRNA-Gly  89.36 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0041  tRNA-Gly  89.36 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142382  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0042  tRNA-Gly  89.36 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177024  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0043  tRNA-Gly  89.36 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0822724  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0044  tRNA-Gly  89.36 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0345012  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0029  tRNA-Gly  89.36 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11864  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0739  tRNA-Gly  89.36 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.158339  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1545  tRNA-Gly  89.36 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0092  tRNA-Gly  84.75 
 
 
71 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000423712  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0042  tRNA-Gly  89.36 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443767  normal  0.830121 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2245  tRNA-Gly  89.36 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  89.36 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.82132  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0022  tRNA-Gly  89.36 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0043  tRNA-Gly  89.36 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000132411  normal  0.194852 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t34  tRNA-Gly  89.36 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.417453  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0020  tRNA-Gly  89.36 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000165408  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0028  tRNA-Gly  89.36 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000313605  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0037  tRNA-Gly  89.36 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.133837  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0891  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  89.36 
 
 
777 bp  46.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.101452  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0038  tRNA-Gly  89.36 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.148988  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0028  tRNA-Gly  89.36 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0030  tRNA-Gly  89.36 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000189578  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1730  tRNA-Gly  89.36 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.873105  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1755  tRNA-Gly  89.36 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1978  tRNA-Gly  89.36 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2165  tRNA-Gly  89.36 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1013  tRNA-Gly  89.36 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1789  tRNA-Gly  89.13 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.212776  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0087  tRNA-Gly  89.47 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0256242  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0091  tRNA-Gly  89.47 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178769  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0056  tRNA-Gly  89.47 
 
 
71 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869004  normal  0.328325 
 
 
-
 
NC_006369  lplt36  tRNA-Gly  89.13 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt36  tRNA-Gly  89.13 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26280  tRNA-Gly  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t25  tRNA-Gly  89.47 
 
 
71 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.532363  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>