298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRAt08 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009504  BOV_A0959  tRNA-Gly  100 
 
 
77 bp  149  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0005  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118248  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0052  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.165358 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0015  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409791  hitchhiker  0.00133566 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt08  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.711822  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt09  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745225  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0045  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.471231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0060  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.766632 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0054  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.290496  normal  0.747562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0060  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312952  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0061  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.638683  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0063  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0052  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0058  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0004  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.54255  normal  0.0153905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0014  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.854137  normal  0.0928806 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0059  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.07343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0055  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.9646 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0024  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113773  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0060  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18005  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0037  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0007  tRNA-Gly  98.67 
 
 
75 bp  141  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4576  tRNA-Gly  98.67 
 
 
75 bp  141  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0839  tRNA-Gly  98.67 
 
 
77 bp  141  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.343418  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0005  tRNA-Gly  98.67 
 
 
75 bp  141  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0042  tRNA-Gly  98.67 
 
 
75 bp  141  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0046  tRNA-Gly  98.67 
 
 
75 bp  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0040  tRNA-Gly  97.33 
 
 
75 bp  133  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471615  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0046  tRNA-Gly  97.33 
 
 
75 bp  133  6e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0001    97.33 
 
 
75 bp  133  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0451223 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0001  tRNA-Gly  97.33 
 
 
75 bp  133  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0044  tRNA-Gly  96 
 
 
75 bp  125  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.69312  normal  0.302799 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0004  tRNA-Gly  96 
 
 
75 bp  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.679327 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0016  tRNA-Gly  94.67 
 
 
75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA4  tRNA-Gly  94.67 
 
 
75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0015  tRNA-Gly  94.67 
 
 
75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0054  tRNA-Gly  94.67 
 
 
75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0070  tRNA-Gly  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0053  tRNA-Gly  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6044  tRNA-Gly  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0027  tRNA-Gly  100 
 
 
77 bp  103  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0004  tRNA-OTHER  100 
 
 
67 bp  99.6  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0061  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  99.6  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  98.11 
 
 
75 bp  97.6  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.36527  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0050  tRNA-Gly  92.75 
 
 
75 bp  97.6  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00165947  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0010  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0029  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.122456  normal  0.962051 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0033  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.548624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0034  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.558867 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0035  tRNA-Gly  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2331  tRNA-Gly  96.23 
 
 
75 bp  89.7  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0152091  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  96.23 
 
 
75 bp  89.7  8e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.82132  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2253  tRNA-Gly  96.23 
 
 
75 bp  89.7  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0739  tRNA-Gly  96.23 
 
 
72 bp  89.7  8e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.158339  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1755  tRNA-Gly  96.23 
 
 
75 bp  89.7  8e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1978  tRNA-Gly  96.23 
 
 
75 bp  89.7  8e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2165  tRNA-Gly  96.23 
 
 
75 bp  89.7  8e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1545  tRNA-Gly  96.23 
 
 
72 bp  89.7  8e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1730  tRNA-Gly  96.23 
 
 
75 bp  89.7  8e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.873105  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0891  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  96.23 
 
 
777 bp  89.7  8e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.101452  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2245  tRNA-Gly  96.23 
 
 
75 bp  89.7  8e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0028  tRNA-Gly  91.18 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.433481  normal  0.466553 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0044  tRNA-Gly  91.18 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0054  tRNA-Gly  90.79 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0271354  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0008  tRNA-Gly  90.79 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0031  tRNA-Gly  91.18 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.000029648 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0046  tRNA-Gly  91.18 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.098729  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0030  tRNA-Gly  90.79 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121021  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0002  tRNA-Gly  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.385644 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0055  tRNA-Gly  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.138155  hitchhiker  0.00896758 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0021  tRNA-Gly  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205707  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0023  tRNA-Gly  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000214158  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0015  tRNA-Ser  96 
 
 
67 bp  83.8  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0082796  normal 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  90.41 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0044  tRNA-Gly  94.34 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00255441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0072  tRNA-Gly  94.34 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0073  tRNA-Gly  94.34 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611784  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1033  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.573646  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1789  tRNA-Gly  94.34 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.212776  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0031  tRNA-Gly  94.12 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0051  tRNA-Gly  91.53 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0500664 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0017  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.432815  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0023  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0047  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.722029  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0029  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.649765  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4296  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.514839  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4344  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0932654  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0019  tRNA-Gly  91.53 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00502278  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0005  tRNA-Gly  94.12 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000151844  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0049  tRNA-Gly  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.203565  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0035  tRNA-Gly  94 
 
 
75 bp  75.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0213758  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0017  tRNA-Gly  94 
 
 
75 bp  75.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0855  tRNA-Gly  94 
 
 
75 bp  75.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0028  tRNA-Gly  94 
 
 
75 bp  75.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.706726  normal  0.167752 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0020  tRNA-Gly  94 
 
 
75 bp  75.8  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000165408  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0028  tRNA-Gly  94 
 
 
75 bp  75.8  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000313605  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0025  tRNA-Gly  94 
 
 
75 bp  75.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.404716  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0033  tRNA-Gly  94 
 
 
75 bp  75.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0406258  normal  0.16961 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0037  tRNA-Gly  94 
 
 
75 bp  75.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0254902  normal  0.171485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>