57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-His-1 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  tRNA-His-1  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.8842  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-His-2  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0092  tRNA-His  95.59 
 
 		 73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt01  tRNA-His  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0650  tRNA-His  94.34 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0610  tRNA-His  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5032  tRNA-His  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540758  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5716  tRNA-His  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00269578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5817  tRNA-His  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000694475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0214  tRNA-His  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4767  tRNA-His  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000106847  hitchhiker  8.57127e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0535  tRNA-His  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07108e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5001  tRNA-His  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-His-2  tRNA-His  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000329782  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-His-2  tRNA-His  89.04 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000115828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5681  tRNA-His  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00674866  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5730  tRNA-His  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497791  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-His-1  tRNA-His  89.04 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00869037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-His-2  tRNA-His  89.04 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0207429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-His-1  tRNA-His  89.04 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047518  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-His-2  tRNA-His  89.04 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000344538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-His-1  tRNA-His  89.04 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000104499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-His-1  tRNA-His  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000556995  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0137  tRNA-His  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000594746  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0084  tRNA-His  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624791  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0042  tRNA-His  91.53 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0042  tRNA-His  91.53 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.771364  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0033  tRNA-His  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000862189  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0033  tRNA-His  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000464813  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0087  tRNA-His  92.45 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0080  tRNA-His  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0289577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0107  tRNA-His  92.45 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.576525  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0048  tRNA-His  92.45 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0088  tRNA-His  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0130183  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R03  tRNA-His  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.890887  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2565  tRNA-His  88.89 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0141  tRNA-His  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000990259  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-His-1  tRNA-His  87.3 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-His-2  tRNA-His  87.3 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2211  tRNA-His  89.13 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240288  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2136  tRNA-His  89.13 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00922633  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1684  tRNA-His  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.592978  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1469  tRNA-His  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0005  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000162881  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1593  tRNA-His  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000819622  normal  0.473468 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0110  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0088  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0064  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0047  tRNA-His  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0078  tRNA-His  83.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0092  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000423712  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0086  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795168  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0081  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0459508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0052  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000802106  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2041  tRNA-His  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000147998  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1762  tRNA-His  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-His-1  tRNA-His  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.34848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>