184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2136 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2211  tRNA-His  100 
 
 		 79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240288  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2136  tRNA-His  100 
 
 		 79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00922633  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1684  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.592978  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1469  tRNA-His  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-His-1  tRNA-His  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.34848  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1762  tRNA-His  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2041  tRNA-His  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000147998  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0047  tRNA-His  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1417  tRNA-His  95.45 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0085  tRNA-His  94.44 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317086  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0050  tRNA-His  90.41 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0027  tRNA-His  89.04 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000752575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0017  tRNA-His  87.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000374304  hitchhiker  0.000000156779 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0070  tRNA-His  87.18 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0203804  normal  0.914236 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0042  tRNA-His  87.67 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0033  tRNA-His  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tHis01  tRNA-His  86.11 
 
 		 80 bp  63.9  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0051  tRNA-His  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000083549  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0037  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0012  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0040  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309279  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.211711 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14029  tRNA-His  85.71 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205987 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0031  tRNA-His  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679826  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0019  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.2337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309368  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0022  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0011  tRNA-His  84 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309103  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0620243  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309135  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309215  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.266005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309176  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-His-1  tRNA-His  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.8842  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-His-2  tRNA-His  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0028  tRNA-His  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.252923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0044  tRNA-His  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000342103  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0041  tRNA-His  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0113138  normal  0.890079 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0021  tRNA-His  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000077385  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0022  tRNA-His  85.71 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0039  tRNA-His  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0312373 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0051  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.584124  normal  0.75185 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t38  tRNA-His  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100556  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0031  tRNA-His  83.56 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000176121  normal  0.0395456 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0042  tRNA-His  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.187364  normal  0.613143 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0038  tRNA-His  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.322941  normal  0.556926 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0018  tRNA-His  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.898186  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0011  tRNA-His  83.33 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0045  tRNA-His  82.67 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000161818  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-His-1  tRNA-His  93.55 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000104499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-His-2  tRNA-His  93.55 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000344538  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-His-1  tRNA-His  93.55 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047518  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-His-2  tRNA-His  93.55 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0207429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-His-1  tRNA-His  93.55 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00869037  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-His-2  tRNA-His  93.55 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000115828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0214  tRNA-His  93.55 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0086  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795168  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0088  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0610  tRNA-His  93.55 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893119  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5817  tRNA-His  93.55 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000694475  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0081  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0459508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0064  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0022  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0010  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0833672 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0018  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.338609  normal  0.373467 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0535  tRNA-His  93.55 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07108e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4767  tRNA-His  93.55 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000106847  hitchhiker  8.57127e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5716  tRNA-His  93.55 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00269578  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0045  tRNA-His  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.447472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5001  tRNA-His  93.55 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5032  tRNA-His  93.55 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540758  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0092  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000423712  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0052  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000802106  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0005  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000162881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0110  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0078  tRNA-His  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0020  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.889352  normal  0.733975 
 
 
-
 
NC_002950  PGt02  tRNA-Asn  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0167081 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5681  tRNA-His  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00674866  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0028  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.79359e-16  unclonable  0.0000000519996 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0040  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0040  tRNA-His  89.13 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0004  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000586808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1474  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000230353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3561  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000191546  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2046  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000148192  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1097  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000222375  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2897  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000182734  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3094  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000516421  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0454906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0039  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000372994  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0054  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00610813  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0065  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00130991  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0072  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00108328  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0084  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.011536  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0008  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000162248  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0018  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000054904  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0066  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000013609  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0083  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000284492  normal  0.0190641 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0495  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328394  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0904  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0066867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>