152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1762 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE_tRNA-His-1  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.34848  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1762  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2041  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000147998  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1684  tRNA-His  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.592978  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2136  tRNA-His  98.7 
 
 		 79 bp  145  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00922633  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2211  tRNA-His  98.7 
 
 		 79 bp  145  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240288  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1469  tRNA-His  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0047  tRNA-His  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1417  tRNA-His  96.49 
 
 		 78 bp  89.7  9e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0050  tRNA-His  91.78 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0085  tRNA-His  94.23 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317086  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0070  tRNA-His  88.46 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0203804  normal  0.914236 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0042  tRNA-His  89.04 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0027  tRNA-His  87.67 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000752575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0051  tRNA-His  87.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000083549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0017  tRNA-His  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000374304  hitchhiker  0.000000156779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0022  tRNA-His  87.14 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0033  tRNA-His  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0039  tRNA-His  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0312373 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0038  tRNA-His  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.322941  normal  0.556926 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0037  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0012  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0040  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tHis01  tRNA-His  88.46 
 
 		 80 bp  56  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309279  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.211711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0020  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.889352  normal  0.733975 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-His-1  tRNA-His  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00107575  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0031  tRNA-His  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679826  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_831  tRNA-His  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000011255  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0027  tRNA-His  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0051  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.584124  normal  0.75185 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14029  tRNA-His  84.42 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205987 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0022  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0038  tRNA-His  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.650606  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0024  tRNA-His  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441767  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309103  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0620243  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309135  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309215  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.266005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0019  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.2337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309176  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0019  tRNA-His  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0563192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309368  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0011  tRNA-His  82.67 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0186  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09670  tRNA-His  84.51 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.253938  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0015  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000558308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0087  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283468  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt02  tRNA-Asn  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0167081 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00665402  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Met-2  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-His-1  tRNA-His  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.8842  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00102646  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Undet-2  tRNA-OTHER  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00119652  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000192753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000169061  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0003  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000281638  normal  0.804824 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0019  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.47791e-17  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0028  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.79359e-16  unclonable  0.0000000519996 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0040  tRNA-His  89.13 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0004  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000586808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1474  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000230353  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1909  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164589  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_CR0085  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000813778  normal  0.199045 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0016  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000072024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0026  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000721993  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0074  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000283868  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0038  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0167531  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2046  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000148192  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3094  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000516421  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0003  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000546839 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0039  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000372994  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0054  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00610813  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0065  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00130991  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0084  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.011536  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0008  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000162248  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0018  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000054904  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0066  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000013609  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0083  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000284492  normal  0.0190641 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_R0089  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000671858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0008  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000320674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0017  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000962066  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0064  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000178729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0080  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000338502  normal  0.0447756 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_R0083  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00594726  hitchhiker  0.00848998 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0021  tRNA-His  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000077385  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0002  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000350772  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0630  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000358951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1168  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133954  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0928  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000151896  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0701  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000189505  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1988  tRNA-OTHER  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000295907  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1329  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00168049  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0592  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000232315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1338  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3568  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0990712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3832  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0495  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328394  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0904  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0066867  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1897  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000326046  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3541  tRNA-OTHER  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00194586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>