179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_R0047 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_R0047  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2211  tRNA-His  96.1 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240288  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2136  tRNA-His  96.1 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00922633  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1684  tRNA-His  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.592978  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1469  tRNA-His  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-His-1  tRNA-His  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.34848  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2041  tRNA-His  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000147998  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1762  tRNA-His  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1417  tRNA-His  93.85 
 
 		 78 bp  89.7  9e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0085  tRNA-His  94.44 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317086  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0027  tRNA-His  87.67 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000752575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0050  tRNA-His  89.04 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tHis01  tRNA-His  87.5 
 
 		 80 bp  71.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0033  tRNA-His  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0017  tRNA-His  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000374304  hitchhiker  0.000000156779 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0031  tRNA-His  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679826  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0037  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0012  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0040  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0070  tRNA-His  85.9 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0203804  normal  0.914236 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309279  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.211711 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0042  tRNA-His  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.187364  normal  0.613143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0042  tRNA-His  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0051  tRNA-His  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000083549  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0022  tRNA-Arg  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309368  tRNA-Arg  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0019  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.2337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309103  tRNA-Arg  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0620243  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309135  tRNA-Arg  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309215  tRNA-Arg  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.266005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309176  tRNA-Arg  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0023  tRNA-His  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14029  tRNA-His  84.42 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205987 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0051  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.584124  normal  0.75185 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0063  tRNA-His  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000214057  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0064  tRNA-His  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000223288  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0029  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t026  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t099  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0017  tRNA-Lys  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.674136 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0026  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00252757  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0132  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0041  tRNA-His  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0113138  normal  0.890079 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0038  tRNA-His  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.322941  normal  0.556926 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0044  tRNA-His  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000342103  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0143  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0386713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0011  tRNA-His  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0144  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00158556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0009  tRNA-His  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0020  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000738141  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0085  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240103  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0021  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000629735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0115  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000444508  normal  0.0132879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0115  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000103194  normal  0.0493795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0136  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000000985784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0019  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.301906  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0085  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000420943  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0040  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000863654  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0015  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0050  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000822334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0021  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00392038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0112  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000282154  normal  0.565936 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0021  tRNA-His  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000077385  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0048  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000353919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0125  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0142  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788034  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0048  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000560154  hitchhiker  0.0000786314 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0118  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.295265  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0028  tRNA-His  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.252923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0029  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000338332  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0124  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0169657  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09670  tRNA-His  84.51 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.253938  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0101  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839897  decreased coverage  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0028  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000239191  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00665402  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-His-1  tRNA-His  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.8842  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000192753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000169061  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0003  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000281638  normal  0.804824 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0019  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.47791e-17  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1909  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164589  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_CR0085  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000813778  normal  0.199045 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0016  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000072024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0026  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000721993  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0074  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000283868  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0002  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000230131  normal  0.891298 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0054  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00610813  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0065  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00130991  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0072  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00108328  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0084  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.011536  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0008  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000162248  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0018  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000054904  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0066  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000013609  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0083  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000284492  normal  0.0190641 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0701  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000189505  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1338  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3568  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0990712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3832  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0495  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328394  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0904  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0066867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>