44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP_tRNA-His-1 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP_tRNA-His-1  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-His-2  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0033  tRNA-His  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000862189  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0033  tRNA-His  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000464813  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0042  tRNA-His  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.771364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0042  tRNA-His  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4767  tRNA-His  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000106847  hitchhiker  8.57127e-17 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-His-1  tRNA-His  89.47 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000104499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0141  tRNA-His  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000990259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0610  tRNA-His  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5681  tRNA-His  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00674866  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5730  tRNA-His  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5032  tRNA-His  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540758  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5716  tRNA-His  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00269578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5817  tRNA-His  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000694475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0214  tRNA-His  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0535  tRNA-His  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07108e-31 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-His-2  tRNA-His  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000329782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-His-1  tRNA-His  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000556995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-His-2  tRNA-His  89.47 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000115828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-His-1  tRNA-His  89.47 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00869037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5001  tRNA-His  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-His-2  tRNA-His  89.47 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0207429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-His-1  tRNA-His  89.47 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047518  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-His-2  tRNA-His  89.47 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000344538  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0088  tRNA-His  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0130183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0084  tRNA-His  88.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0137  tRNA-His  88.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000594746  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0087  tRNA-His  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.98508e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R03  tRNA-His  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.890887  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-His-1  tRNA-His  87.3 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.8842  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-His-2  tRNA-His  87.3 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0092  tRNA-His  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0078  tRNA-His  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0013  tRNA-His  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0132722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0036  tRNA-His  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.34645  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt01  tRNA-His  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0080  tRNA-His  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0289577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0107  tRNA-His  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.576525  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0038  tRNA-His  88.64 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0027  tRNA-His  88.64 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0048  tRNA-His  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0087  tRNA-His  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1827  tRNA-His  82.43 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.148729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>