50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_R0036 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_R0036  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.34645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0001  tRNA-His  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691209  normal  0.382494 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0043  tRNA-His  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0027  tRNA-His  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0045  tRNA-His  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.169896 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0038  tRNA-His  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0013  tRNA-His  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0132722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0034  tRNA-His  92.75 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144339  normal  0.0310402 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-His-2  tRNA-His  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-His-1  tRNA-His  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5001  tRNA-His  87.04 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5681  tRNA-His  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00674866  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0535  tRNA-His  87.04 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07108e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4767  tRNA-His  87.04 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000106847  hitchhiker  8.57127e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0214  tRNA-His  87.04 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0084  tRNA-His  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0137  tRNA-His  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000594746  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0141  tRNA-His  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000990259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5817  tRNA-His  87.04 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000694475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5716  tRNA-His  87.04 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00269578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5032  tRNA-His  87.04 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0610  tRNA-His  87.04 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893119  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-His-2  tRNA-His  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000329782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-His-1  tRNA-His  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000556995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-His-2  tRNA-His  87.04 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000115828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-His-1  tRNA-His  87.04 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00869037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-His-2  tRNA-His  87.04 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0207429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-His-1  tRNA-His  87.04 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047518  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-His-2  tRNA-His  87.04 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000344538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-His-1  tRNA-His  87.04 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000104499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5730  tRNA-His  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497791  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAHisVIMSS1309131  tRNA-His  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.487873  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAHisVIMSS1309099  tRNA-His  84.06 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0050  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0058  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606593  hitchhiker  0.000424792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60220  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0043  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.130453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0041  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.137953 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0066  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.308433  normal  0.0175019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0064  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540821  normal  0.0431987 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3505  tRNA-His  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3503  tRNA-His  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t51  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297022  normal  0.0342999 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0056  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441531  hitchhiker  0.000421816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0040  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.262855 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAHisVIMSS1309211  tRNA-His  85.19 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41330  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.908879  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0024  tRNA-His  85.19 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0015  tRNA-His  85.19 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t53  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266756  normal  0.0215353 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>