46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_R0045 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_R0045  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.169896 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0001  tRNA-His  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691209  normal  0.382494 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0038  tRNA-His  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0027  tRNA-His  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0036  tRNA-His  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.34645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0043  tRNA-His  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0013  tRNA-His  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0132722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0034  tRNA-His  89.86 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144339  normal  0.0310402 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAHisVIMSS1309099  tRNA-His  85.51 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAHisVIMSS1309211  tRNA-His  87.04 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0078  tRNA-His  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0024  tRNA-His  87.04 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0015  tRNA-His  87.04 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0029  tRNA-His  84.06 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAHisVIMSS1309381  tRNA-His  84.06 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAHisVIMSS1309172  tRNA-His  84.06 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAHisVIMSS1309297  tRNA-His  84.06 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105395 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAHisVIMSS1309131  tRNA-His  84.06 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.487873  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0033  tRNA-His  84.06 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0037  tRNA-Gln  88.37 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0225857  normal  0.764291 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5032  tRNA-His  89.47 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5730  tRNA-His  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497791  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 104 bp  44.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-His-1  tRNA-His  89.47 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000104499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-His-2  tRNA-His  89.47 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000344538  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-His-1  tRNA-His  89.47 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5001  tRNA-His  89.47 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0535  tRNA-His  89.47 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07108e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4767  tRNA-His  89.47 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000106847  hitchhiker  8.57127e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0214  tRNA-His  89.47 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183126  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-His-2  tRNA-His  89.47 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0207429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-His-1  tRNA-His  89.47 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00869037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5817  tRNA-His  89.47 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000694475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5716  tRNA-His  89.47 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00269578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0610  tRNA-His  89.47 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893119  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0037  tRNA-Gln  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6023  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0137  tRNA-His  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000594746  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0084  tRNA-His  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624791  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-His-1  tRNA-His  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000556995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-His-2  tRNA-His  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000329782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5681  tRNA-His  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00674866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-His-2  tRNA-His  89.47 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000115828  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0001  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0040  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000505544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>