33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_tRNAHisVIMSS1309099 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_tRNAHisVIMSS1309099  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAHisVIMSS1309381  tRNA-His  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAHisVIMSS1309172  tRNA-His  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0029  tRNA-His  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0033  tRNA-His  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAHisVIMSS1309297  tRNA-His  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105395 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAHisVIMSS1309131  tRNA-His  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.487873  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0015  tRNA-His  95.45 
 
 		 73 bp  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0024  tRNA-His  95.45 
 
 		 73 bp  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAHisVIMSS1309211  tRNA-His  95.45 
 
 		 73 bp  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0013  tRNA-His  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0132722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19911  hypothetical protein  97.62 
 
 		 267 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.110638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0034  tRNA-His  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144339  normal  0.0310402 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0014  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.349887  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0038  tRNA-His  86.96 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0027  tRNA-His  86.96 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0043  tRNA-His  85.51 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0001  tRNA-His  85.51 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691209  normal  0.382494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0045  tRNA-His  85.51 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.169896 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0023  tRNA-Gln  88.33 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0444305  normal  0.71139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0021  tRNA-Gln  88.33 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0591367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0022  tRNA-Gln  88.33 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4327  tRNA-Gln  88.33 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0036  tRNA-His  84.06 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.34645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0022  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0064  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0047  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0069  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476746  normal  0.206288 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4346  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.850854  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0074  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.181678 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0011  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.144781  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0032  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000308987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0018  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>