24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_R0043 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_R0043  tRNA-His  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0001  tRNA-His  97.26 
 
 
73 bp  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691209  normal  0.382494 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0036  tRNA-His  94.52 
 
 
73 bp  113  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.34645  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0038  tRNA-His  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0027  tRNA-His  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0034  tRNA-His  92.75 
 
 
73 bp  97.6  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144339  normal  0.0310402 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0045  tRNA-His  91.78 
 
 
73 bp  97.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.169896 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0013  tRNA-His  91.78 
 
 
76 bp  97.6  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0132722  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAHisVIMSS1309131  tRNA-His  85.51 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.487873  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAHisVIMSS1309099  tRNA-His  85.51 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAHisVIMSS1309211  tRNA-His  87.04 
 
 
73 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0024  tRNA-His  87.04 
 
 
73 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0015  tRNA-His  87.04 
 
 
73 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0033  tRNA-His  84.06 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAHisVIMSS1309297  tRNA-His  84.06 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105395 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAHisVIMSS1309172  tRNA-His  84.06 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAHisVIMSS1309381  tRNA-His  84.06 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0029  tRNA-His  84.06 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lplt23  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt23  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0029  tRNA-His  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.499357  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0053  tRNA-Gln  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.203875  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt35  tRNA-His  100 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4559  tRNA-Gln  90.48 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>