147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_R0032 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_R0032  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000308987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0049  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859256  hitchhiker  0.000000216539 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0014  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.349887  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlnVIMSS1309367  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0011  tRNA-Gln  91.94 
 
 		 72 bp  83.8  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4327  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0047  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.907945  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0815  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.0000000161826  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0022  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0023  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0444305  normal  0.71139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0021  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0591367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0022  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0036  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0033  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0064  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0012  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12185  normal  0.483393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0074  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.181678 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0069  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476746  normal  0.206288 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2162  tRNA-Gln  92.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.133537  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2251  tRNA-Gln  92.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlnVIMSS1309278  tRNA-Gln  90.32 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1452  tRNA-Gln  92.45 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0029  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0047  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00177856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4346  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.850854  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0037  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0225857  normal  0.764291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0016  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0001  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.275531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0041  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0052  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0038  tRNA-Gln  88.71 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0007  tRNA-Gln  88.71 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.102252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0008  tRNA-Gln  88.71 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0048  tRNA-Gln  88.71 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509197 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t18  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t54  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0869713 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60300  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.18805  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t18  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA19  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.488771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R46  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856686  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R75  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0688488  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0070  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61760  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.486139  hitchhiker  0.00483017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0044  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.275376 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0050  tRNA-Gln  87.67 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.124886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60290  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184905  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0014  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.474255  normal  0.24378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0015  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365427  normal  0.400071 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0029  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0055  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5319  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11036  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0033  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0067  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963096  normal  0.0255259 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0027  tRNA-Gln  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000292778  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0046  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.53716e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0001  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0011  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.144781  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0049  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.0255901 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0008  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.865665  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0018  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0051  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0016  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA16  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0047  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0068  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0493446  normal  0.903824 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0021  tRNA-Gln  87.1 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0039  tRNA-Gln  87.1 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.588412  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGlnVIMSS1309102  tRNA-Gln  87.1 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGlnVIMSS1309134  tRNA-Gln  87.1 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.500846  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlnVIMSS1309214  tRNA-Gln  87.1 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGlnVIMSS1309175  tRNA-Gln  87.1 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0005  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000119132  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0023  tRNA-Gln  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00187779  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0454  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000558328  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0020  tRNA-Gln  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188813 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0055  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00371124  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.693396  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0017  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0205795  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0002  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0008  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.825941  normal  0.0317691 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0012  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0055  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000526045  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0035  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.446482  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0004  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.40819e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0012  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.376695  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0048  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.807187  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0014  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323389  normal  0.291127 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0022  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.310652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0064  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00065623  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0029  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0040  tRNA-Gln  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0043  tRNA-Gln  85.71 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150748  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0048  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0051  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00516636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0052  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00572206  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1723  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1099  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000225043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>