201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_R0049 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_R0049  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859256  hitchhiker  0.000000216539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0032  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000308987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0007  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.102252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0048  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509197 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0008  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0011  tRNA-Gln  94.64 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlnVIMSS1309367  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2251  tRNA-Gln  91.94 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2162  tRNA-Gln  91.94 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.133537  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0069  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476746  normal  0.206288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0064  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlnVIMSS1309278  tRNA-Gln  92.86 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0074  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.181678 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0022  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1452  tRNA-Gln  90.32 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00709266  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0064  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00065623  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0052  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0047  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00177856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0041  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0038  tRNA-Gln  91.07 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0037  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0225857  normal  0.764291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0118  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119427  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0117  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121705  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0101  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000260011  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0103  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000561751  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0104  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000537672  normal  0.102798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0109  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000000980988  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0110  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000374074  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0127  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000119757  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0126  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000574735  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0029  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0029  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t012  tRNA-Gln  87.32 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000011091  hitchhiker  0.000000000474372 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t011  tRNA-Gln  87.32 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000894711  hitchhiker  0.000000000511472 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0014  tRNA-Gln  88.71 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.349887  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0027  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000292778  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0059  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.436402  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0021  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0005  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0017  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000337477  normal  0.142924 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0041  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000496114  hitchhiker  0.0000000000277547 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0039  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.588412  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0049  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.0255901 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0008  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.865665  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0051  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGlnVIMSS1309102  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGlnVIMSS1309134  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.500846  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlnVIMSS1309214  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGlnVIMSS1309175  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2234  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0454  tRNA-Gln  87.1 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000558328  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0123  tRNA-Gln  87.67 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00201303  hitchhiker  0.000458839 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0039  tRNA-Gln  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00156517  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4327  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0815  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.0000000161826  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0114  tRNA-Gln  87.67 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000001247  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1099  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000225043  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1723  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0023  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0444305  normal  0.71139 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0106  tRNA-Gln  87.67 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000012042  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0021  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0591367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0022  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0605  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0026  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.151797  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.693396  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0028  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.242939  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0065  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000612595  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t016  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t017  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t020  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0067  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t015  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000513165  hitchhiker  0.000000000516486 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0017  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0205795  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln01  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017749  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln02  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00912183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0034  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495722  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0035  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000486361  normal  0.144926 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0038  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000374137  normal  0.148016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0035  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000023217  normal  0.116994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0036  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000579663  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0039  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000688787  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0012  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0033  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210301  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0034  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257252  normal  0.0258068 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0037  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000116845  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0094  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300776  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0097  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000737452  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0098  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000673061  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0099  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895438  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0012  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.376695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0031  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750254  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4257  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.43895e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0330  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000145086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4258  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.53905e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0030  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>