85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_R0068 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_R0068  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0493446  normal  0.903824 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0004  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.40819e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0001  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.275531 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0006  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.404831 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0051  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0047  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.907945  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0014  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.349887  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0008  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.825941  normal  0.0317691 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0018  tRNA-Gln  86.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0048  tRNA-Gln  86.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.807187  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0032  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000308987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0047  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0047  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00177856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0025  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.693396  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0035  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.446482  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0010  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277758  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0052  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0374404  unclonable  6.3728200000000006e-24 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0044  tRNA-Gln  96.77 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126068 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0074  tRNA-Gln  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.181678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0064  tRNA-Gln  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0001  tRNA-Gln  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0069  tRNA-Gln  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476746  normal  0.206288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0022  tRNA-Gln  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0008  tRNA-Gln  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.865665  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0016  tRNA-Gln  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0017  tRNA-Gln  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0205795  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0049  tRNA-Gln  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.0255901 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t41  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.821705  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0046  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.53716e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0036  tRNA-Gln  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0005  tRNA-Gln  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000119132  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0033  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0012  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12185  normal  0.483393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0026  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327686  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0001  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0058  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0002  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0052  tRNA-Gln  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1924  tRNA-Gln  86.54 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00590264  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0236  tRNA-Gln  86.54 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0012758  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4327  tRNA-Gln  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0012  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0041  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0011  tRNA-Gln  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.144781  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0022  tRNA-Gln  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0021  tRNA-Gln  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0591367 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0023  tRNA-Gln  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0444305  normal  0.71139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0029  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0003  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0023  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00187779  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0018  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0069  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0034  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00361303  normal  0.0286488 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0506396  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0028  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109665  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0015  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365427  normal  0.400071 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGlnVIMSS1309134  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.500846  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t18  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA19  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.488771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0021  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R46  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856686  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R75  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0688488  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0039  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.588412  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0028  tRNA-Gln  84.42 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0049  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.428212 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0168  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0061  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0203947  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0019  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349932  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0040  tRNA-Cys  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGlnVIMSS1309102  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0070  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlnVIMSS1309214  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGlnVIMSS1309175  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0014  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.474255  normal  0.24378 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0029  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0055  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5319  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11036  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0014  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0046  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0289454  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlnVIMSS1309367  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0033  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0067  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963096  normal  0.0255259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0044  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.275376 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>