287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_R0048 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_R0048  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509197 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0007  tRNA-Gln  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.102252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0008  tRNA-Gln  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlnVIMSS1309367  tRNA-Gln  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0052  tRNA-Gln  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0038  tRNA-Gln  98.21 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0011  tRNA-Gln  98.21 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0037  tRNA-Gln  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0225857  normal  0.764291 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0101  tRNA-Gln  93.06 
 
 		 75 bp  103  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000260011  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0103  tRNA-Gln  93.06 
 
 		 75 bp  103  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000561751  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0104  tRNA-Gln  93.06 
 
 		 75 bp  103  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000537672  normal  0.102798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0049  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859256  hitchhiker  0.000000216539 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlnVIMSS1309278  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0008  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.865665  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0029  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0094  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300776  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.693396  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t016  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t017  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t020  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0047  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00177856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0041  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000496114  hitchhiker  0.0000000000277547 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0098  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000673061  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0029  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0049  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.0255901 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0064  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00065623  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0041  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln01  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017749  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln02  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00912183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0034  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495722  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0035  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000486361  normal  0.144926 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0038  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000374137  normal  0.148016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0035  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000023217  normal  0.116994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0036  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000579663  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0039  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000688787  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0033  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210301  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0034  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257252  normal  0.0258068 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0037  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000116845  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0097  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000737452  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0007  tRNA-Gln  91.8 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.791549  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1769  tRNA-Gln  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157848  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1766  tRNA-Gln  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000182708  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t06  tRNA-Gln  91.8 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt09  tRNA-Gln  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt09  tRNA-Gln  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0008  tRNA-Gln  91.8 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.970868  normal  0.737558 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0039  tRNA-Gln  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00156517  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0515  tRNA-Gln  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1775  tRNA-Gln  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000331102  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0103  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0102  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00709266  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0059  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.436402  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0021  tRNA-Gln  92.86 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0017  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000337477  normal  0.142924 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0039  tRNA-Gln  92.86 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.588412  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGlnVIMSS1309175  tRNA-Gln  92.86 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0064  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0069  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476746  normal  0.206288 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlnVIMSS1309214  tRNA-Gln  92.86 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0012  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.376695  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0074  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.181678 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0022  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGlnVIMSS1309102  tRNA-Gln  92.86 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGlnVIMSS1309134  tRNA-Gln  92.86 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.500846  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2234  tRNA-Gln  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0070  tRNA-Gln  90.32 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000111082  normal  0.043537 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0001  tRNA-Gln  90.32 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.275531 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0074  tRNA-Gln  90.32 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000739317  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0072  tRNA-Gln  90.32 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000124926  normal  0.0423905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4346  tRNA-Gln  90.16 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.850854  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6012  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0005  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0043  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.394082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0090  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.925974  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0011  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0099  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895438  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3564  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570193  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3565  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0040  tRNA-Gln  90.48 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0014  tRNA-Gln  88.71 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.349887  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0032  tRNA-Gln  88.71 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000308987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1452  tRNA-Gln  88.71 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0028  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0061  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0270894  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0132  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000056335  normal  0.277016 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4327  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0016  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0023  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0444305  normal  0.71139 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0011  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.144781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0030  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4559  tRNA-Gln  90.16 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0025  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0022  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0021  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0591367 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0017  tRNA-Gln  95.12 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0205795  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0001  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1773  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047284  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0419  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0333429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>