181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_tRNAGlnVIMSS1309278 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_tRNAGlnVIMSS1309278  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0038  tRNA-Gln  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0011  tRNA-Gln  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0021  tRNA-Gln  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0039  tRNA-Gln  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.588412  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlnVIMSS1309367  tRNA-Gln  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGlnVIMSS1309102  tRNA-Gln  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGlnVIMSS1309134  tRNA-Gln  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.500846  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlnVIMSS1309214  tRNA-Gln  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGlnVIMSS1309175  tRNA-Gln  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0007  tRNA-Gln  98.31 
 
 		 72 bp  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.102252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0008  tRNA-Gln  98.31 
 
 		 72 bp  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0052  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0048  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0047  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00177856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0037  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0225857  normal  0.764291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0064  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0074  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.181678 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0022  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0069  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476746  normal  0.206288 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln01  tRNA-Gln  92.98 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017749  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln02  tRNA-Gln  92.98 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00912183  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0094  tRNA-Gln  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300776  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0097  tRNA-Gln  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000737452  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0098  tRNA-Gln  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000673061  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0099  tRNA-Gln  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895438  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0041  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0049  tRNA-Gln  92.86 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859256  hitchhiker  0.000000216539 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0029  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0012  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t011  tRNA-Gln  92.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000894711  hitchhiker  0.000000000511472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0117  tRNA-Gln  92.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121705  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0127  tRNA-Gln  92.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000119757  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0126  tRNA-Gln  92.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000574735  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t012  tRNA-Gln  92.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000011091  hitchhiker  0.000000000474372 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0118  tRNA-Gln  92.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119427  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0109  tRNA-Gln  92.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000000980988  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0110  tRNA-Gln  92.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000374074  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0032  tRNA-Gln  90.32 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000308987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0014  tRNA-Gln  90.32 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.349887  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4327  tRNA-Gln  90.16 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0023  tRNA-Gln  90.16 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0444305  normal  0.71139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0021  tRNA-Gln  90.16 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0591367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0022  tRNA-Gln  90.16 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0102  tRNA-Gln  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0103  tRNA-Gln  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0001  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0008  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.865665  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0132  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000056335  normal  0.277016 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0064  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00065623  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0029  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0101  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000260011  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0103  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000561751  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0104  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000537672  normal  0.102798 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1766  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000182708  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1769  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157848  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1775  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000331102  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t016  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t017  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t020  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4346  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.850854  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0034  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495722  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0035  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000486361  normal  0.144926 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0038  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000374137  normal  0.148016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0035  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000023217  normal  0.116994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0036  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000579663  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0039  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000688787  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0033  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210301  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0034  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257252  normal  0.0258068 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0037  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000116845  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.693396  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0009  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.001106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0123  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00201303  hitchhiker  0.000458839 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t015  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000513165  hitchhiker  0.000000000516486 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0114  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000001247  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0040  tRNA-Gln  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0106  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000012042  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0047  tRNA-Gln  87.1 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.907945  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0048  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0051  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00516636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0052  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00572206  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0008  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.970868  normal  0.737558 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t06  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0007  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.791549  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0028  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000428392  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0029  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0032  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333525  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0092  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.603959  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0515  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0039  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00156517  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0018  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000387356  hitchhiker  0.0000000187085 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0006  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.404831 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0090  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.925974  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0051  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1773  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047284  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt09  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt09  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0041  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.694008  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0036  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000169223  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0037  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000166881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>