135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_R0041 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_R0041  tRNA-Gln  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.694008  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0018  tRNA-Gln  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0036  tRNA-Gln  97.83 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000169223  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0037  tRNA-Gln  97.83 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000166881  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0040  tRNA-Gln  97.83 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000435375  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0106  tRNA-Gln  97.83 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000012042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t015  tRNA-Gln  97.83 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000513165  hitchhiker  0.000000000516486 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0114  tRNA-Gln  97.83 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000001247  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0123  tRNA-Gln  97.83 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00201303  hitchhiker  0.000458839 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2234  tRNA-Gln  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0059  tRNA-Gln  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.436402  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0042  tRNA-Gln  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0043  tRNA-Gln  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.613613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0043  tRNA-Gln  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.693396  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0077  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.273765 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0002  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0427348  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0003  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0005  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187947  hitchhiker  0.00431383 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0109  tRNA-Gln  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000000980988  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0110  tRNA-Gln  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000374074  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t011  tRNA-Gln  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000894711  hitchhiker  0.000000000511472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0117  tRNA-Gln  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121705  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0118  tRNA-Gln  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119427  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t012  tRNA-Gln  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000011091  hitchhiker  0.000000000474372 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0001  tRNA-Gln  87.01 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0126  tRNA-Gln  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000574735  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0127  tRNA-Gln  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000119757  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00709266  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0005  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0041  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000496114  hitchhiker  0.0000000000277547 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0028  tRNA-Gln  93.18 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000428392  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0029  tRNA-Gln  93.18 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0032  tRNA-Gln  93.18 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333525  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0011  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0024  tRNA-Gln  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0010  tRNA-Gln  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.311507 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0020  tRNA-Gln  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.078566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0046  tRNA-Gln  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450062 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0013  tRNA-Gln  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.854264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0009  tRNA-Gln  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0069  tRNA-Gln  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0009  tRNA-Gln  85.71 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.001106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0101  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000260011  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0103  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000561751  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0104  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000537672  normal  0.102798 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0004  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.40819e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t016  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t017  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t020  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt09  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt09  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0001  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.587536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0055  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00371124  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0001  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.857987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln01  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017749  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln02  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00912183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0034  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495722  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0035  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000486361  normal  0.144926 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0038  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000374137  normal  0.148016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0035  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000023217  normal  0.116994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0036  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000579663  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0039  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000688787  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0328  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000157113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0033  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210301  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0034  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257252  normal  0.0258068 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0037  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000116845  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0033  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000000894061  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0094  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300776  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0097  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000737452  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0098  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000673061  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0055  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000526045  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4260  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.09084e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0132  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000056335  normal  0.277016 
 
 
-
 
NC_003295  RS03325  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000226692  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0806807  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0021  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0754  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0039  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.588412  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0014  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0148623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0005  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0087  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGlnVIMSS1309102  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGlnVIMSS1309134  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.500846  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlnVIMSS1309214  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlnVIMSS1309278  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0062  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1503  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000219076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0570  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000532927  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0586  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.228924  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2931  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000617655  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGlnVIMSS1309175  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0045  tRNA-Gln  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000078833  normal  0.0156907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0046  tRNA-Gln  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000171717  normal  0.0156007 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0005  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.460384  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0064  tRNA-Gln  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0165002  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0032  tRNA-Gln  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000363695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0017  tRNA-Gln  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000337477  normal  0.142924 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0003  tRNA-Gln  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>