261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_R0003 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_R0003  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0029  tRNA-Gln  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0012  tRNA-Gln  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0041  tRNA-Gln  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0022  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0047  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.907945  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0064  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0008  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.865665  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0074  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.181678 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0069  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476746  normal  0.206288 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.693396  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0005  tRNA-Gln  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0035  tRNA-Gln  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.446482  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0515  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0008  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.970868  normal  0.737558 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0051  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000244153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0017  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000337477  normal  0.142924 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0007  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.791549  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0059  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.436402  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0012  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.644103  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2234  tRNA-Gln  90.54 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t06  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2765  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.114736  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0008  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.112331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0043  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000274188  normal  0.032981 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0046  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.53716e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0001  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.275531 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0046  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.814409 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0061  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0203947  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0009  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.001106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0008  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.629298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0419  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0333429  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0830  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000784737  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00011  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000114888  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00012  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000124601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0063  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.51209e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0064  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.7933e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0045  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000078833  normal  0.0156907 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0735  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000520956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0464  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.99671e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0578  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.87866e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0064  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0165002  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0689  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0037  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0225857  normal  0.764291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0033  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000363695  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0032  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666816  hitchhiker  0.000769415 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5017  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0761  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000167269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0032  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000363695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0063  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0160878  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0721  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000153053  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0782  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000722917  normal  0.446267 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0783  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000582426  normal  0.4419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0722  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000907062  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0077  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0690  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0076  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0033  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000706309  hitchhiker  0.000775918 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4651  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.16576e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0736  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000556049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5016  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149408  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4652  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.35384e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0046  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000171717  normal  0.0156007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0794  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000236079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0795  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000207498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0760  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000001352  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00709266  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4559  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4346  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.850854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0030  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0001  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0061  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0270894  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0014  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.349887  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0026  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327686  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0039  tRNA-Gln  87.84 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00156517  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0829  tRNA-Gln  88.24 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000799298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4327  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0029  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000654097  hitchhiker  0.000794999 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0041  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000496114  hitchhiker  0.0000000000277547 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0022  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0021  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0591367 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0052  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0374404  unclonable  6.3728200000000006e-24 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0101  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000260011  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0103  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000561751  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0104  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000537672  normal  0.102798 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0004  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.40819e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0023  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0444305  normal  0.71139 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0132  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000056335  normal  0.277016 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0053  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.203875  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0123  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000509299  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0119  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00174205  normal  0.184991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0149  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000775027  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0047  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00177856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0121  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.18894 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0147  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000746626  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0151  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916325  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlnVIMSS1309367  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0030  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629379  hitchhiker  0.000801713 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0126  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000102885  normal  0.191984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>