111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_R0018 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_R0018  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000387356  hitchhiker  0.0000000187085 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0028  tRNA-Gln  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0025  tRNA-Gln  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4327  tRNA-Gln  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0023  tRNA-Gln  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0444305  normal  0.71139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0021  tRNA-Gln  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0591367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0022  tRNA-Gln  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0037  tRNA-Gln  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0005  tRNA-Gln  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4346  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.850854  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0036  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000000427859  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0015  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.060017  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0050  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000077158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0515  tRNA-Gln  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0008  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.970868  normal  0.737558 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0007  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.791549  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t06  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0001  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.275531 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t41  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.821705  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0028  tRNA-Gln  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127569  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  97.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0047  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.907945  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0017  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000220842  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0008  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.865665  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0066  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0081  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000262166  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0014  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.349887  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0069  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476746  normal  0.206288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0022  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0064  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0074  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.181678 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0018  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlnVIMSS1309367  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R24  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0008  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0048  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509197 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0007  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.102252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0011  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlnVIMSS1309278  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6012  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0047  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0002  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0012  tRNA-Gln  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0236  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0012758  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1924  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00590264  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0419  tRNA-Gln  85.71 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0333429  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0035  tRNA-Gln  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.446482  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0028  tRNA-Gln  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0041  tRNA-Gln  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0029  tRNA-Gln  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4559  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0008  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.825941  normal  0.0317691 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0049  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.0255901 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0037  tRNA-Cys  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0017  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0205795  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0012  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.376695  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0016  tRNA-Gln  85.96 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363551  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0053  tRNA-Gln  85.96 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000068806  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0012  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12185  normal  0.483393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0033  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0048  tRNA-Gln  83.56 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.807187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0004  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.40819e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0079  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0038  tRNA-Gln  86.54 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0011  tRNA-Gln  86.54 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0043  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.394082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0535  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t18  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA19  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.488771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R46  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856686  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R75  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0688488  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0032  tRNA-Cys  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0048  tRNA-Gln  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0051  tRNA-Gln  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00516636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0052  tRNA-Gln  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00572206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0049  tRNA-Gln  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0024  tRNA-Cys  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0046  tRNA-Gln  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0014  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.474255  normal  0.24378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0015  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365427  normal  0.400071 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0004  tRNA-Gln  84 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0029  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0055  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0011  tRNA-Cys  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5319  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11036  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0026  tRNA-Gln  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327686  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0033  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0067  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963096  normal  0.0255259 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0004  tRNA-Gln  84 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164549  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0044  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.275376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0070  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0829  tRNA-Gln  84.13 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000799298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0049  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859256  hitchhiker  0.000000216539 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0106  tRNA-Gln  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t18  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0040  tRNA-Cys  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0037  tRNA-Cys  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0042  tRNA-Cys  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.815028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60290  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>