227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_R0016 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_R0053  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000068806  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0016  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363551  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1538  tRNA-Gln  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1545  tRNA-Gln  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.87406e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0536  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34797e-32 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 72 bp  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5652  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000646012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5661  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5682  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5689  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0038  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000497098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0095  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000269172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5143  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000037642  normal  0.817541 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0296  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000266549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 78 bp  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 78 bp  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 78 bp  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000184976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 78 bp  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000158624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 78 bp  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000198835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 78 bp  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0951866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 78 bp  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.75916e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 78 bp  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000252021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 78 bp  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 78 bp  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000616644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 78 bp  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000069751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 78 bp  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000190168  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0047  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000522107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000964949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000106014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000160535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0274  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5727  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000826776  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0611  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000107562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5655  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000792898  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0855  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000488484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5047  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000895408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0172  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0373789 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0038  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0089  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0048  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000232523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0099  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0780  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.63949e-30 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0085  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000545364  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0193  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000238459  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5669  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4766  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101548  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5717  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00280638  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4576  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.0809637 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0032  tRNA-Gln  91.55 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0038  tRNA-Gln  91.55 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.218666  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0046  tRNA-Gln  91.55 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000115177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0088  tRNA-Gln  91.55 
 
 		 72 bp  93.7  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000264747  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0005  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000119132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0095  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224938  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0236  tRNA-Gln  94.55 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0012758  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1924  tRNA-Gln  94.55 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00590264  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0419  tRNA-Gln  92.06 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0333429  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0008  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.629298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0008  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.112331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0168  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 72 bp  83.8  0.000000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0001  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.275531 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0107  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 72 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t06  tRNA-Gln  92.86 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0007  tRNA-Gln  92.86 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.791549  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0008  tRNA-Gln  92.86 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.970868  normal  0.737558 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0515  tRNA-Gln  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0058  tRNA-Gln  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0074  tRNA-Gln  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0041  tRNA-Gln  88.73 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.794543  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4346  tRNA-Gln  92.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.850854  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0074  tRNA-Gln  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0041  tRNA-Gln  88.73 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0006  tRNA-Gln  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.404831 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0072  tRNA-Gln  90.16 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000124926  normal  0.0423905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0070  tRNA-Gln  90.16 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000111082  normal  0.043537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0074  tRNA-Gln  90.16 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000739317  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt012  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00741063  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0406  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.426479  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1847  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00012  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000124601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0064  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.7933e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0076  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0783  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000582426  normal  0.4419 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4652  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.35384e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0794  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000236079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0736  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000556049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0048  tRNA-Gln  87.32 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0051  tRNA-Gln  87.32 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00516636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0052  tRNA-Gln  87.32 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00572206  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0690  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0760  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000001352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0735  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000520956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0023  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0444305  normal  0.71139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0021  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0591367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0022  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0032  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666816  hitchhiker  0.000769415 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0033  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000706309  hitchhiker  0.000775918 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4651  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.16576e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>