229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_R0050 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_R0050  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000077158  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0049  tRNA-Gln  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0106  tRNA-Gln  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0074  tRNA-Gln  95.59 
 
 		 75 bp  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0074  tRNA-Gln  95.59 
 
 		 75 bp  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0066  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0081  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000262166  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0041  tRNA-Gln  98.25 
 
 		 72 bp  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.794543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0041  tRNA-Gln  98.25 
 
 		 72 bp  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5143  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000037642  normal  0.817541 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5717  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00280638  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0296  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000266549  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0095  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000269172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5652  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000646012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5661  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5682  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5689  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231453  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  93.06 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000150139  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000169355  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0048  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000232523  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0172  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0373789 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000184976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000158624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000198835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0951866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.75916e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000252021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000616644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000069751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000190168  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0274  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0780  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.63949e-30 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000964949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000106014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000160535  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5727  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000826776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0099  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157171  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5655  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000792898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4576  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.0809637 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0089  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127178  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4766  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101548  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t1806  tRNA-Gln  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000098323  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2564  tRNA-Gln  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0093  tRNA-Gln  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0638  tRNA-Gln  93.06 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1386  tRNA-Gln  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000259699  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0038  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000497098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0047  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000522107  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0193  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000238459  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0085  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000545364  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0611  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000107562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0855  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000488484  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0038  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258408  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5047  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000895408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0536  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34797e-32 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5669  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0036  tRNA-Gln  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000000427859  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  96.49 
 
 		 72 bp  97.6  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0046  tRNA-Gln  92.65 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000115177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0032  tRNA-Gln  92.65 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0028  tRNA-Gln  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0038  tRNA-Gln  92.65 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.218666  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0025  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0028  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2518  tRNA-Gln  92.42 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0017354  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2529  tRNA-Gln  92.42 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2621  tRNA-Gln  92.42 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0485041  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2222  tRNA-Gln  92.42 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000059382  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2233  tRNA-Gln  92.42 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2307  tRNA-Gln  92.42 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000654744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0088  tRNA-Gln  94.74 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000264747  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0058  tRNA-Gln  94.74 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0107  tRNA-Gln  94.74 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0037  tRNA-Gln  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0095  tRNA-Gln  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0046  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0028  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0048  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000709091  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0005  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0068  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.118963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0046  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.53716e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0052  tRNA-Gln  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0017  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0188037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0024  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6019500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0018  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000387356  hitchhiker  0.0000000187085 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0020  tRNA-Gln  92.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000533123  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0032  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00171845  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0012  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.376695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0048  tRNA-Gln  89.39 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0051  tRNA-Gln  89.39 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00516636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0052  tRNA-Gln  89.39 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00572206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0037  tRNA-Gln  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0015  tRNA-Gln  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.060017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>