174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_R0036 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_R0036  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000000427859  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0028  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0025  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0037  tRNA-Gln  93.42 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0005  tRNA-Gln  93.42 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0050  tRNA-Gln  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000077158  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0015  tRNA-Gln  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.060017  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0018  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000387356  hitchhiker  0.0000000187085 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0028  tRNA-Gln  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0012  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.376695  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4346  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.850854  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0041  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000496114  hitchhiker  0.0000000000277547 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0049  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.0255901 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0004  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164549  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0066  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0081  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000262166  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0004  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00709266  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0106  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4327  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0049  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0023  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0444305  normal  0.71139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0021  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0591367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0022  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0515  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0008  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.970868  normal  0.737558 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0007  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.791549  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t06  tRNA-Gln  88.71 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0048  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509197 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0037  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0225857  normal  0.764291 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0016  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA16  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5652  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000646012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5661  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5682  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5689  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0099  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000184976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000158624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000198835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0951866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.75916e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000252021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000616644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000069751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000190168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0089  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127178  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5727  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000826776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0274  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0048  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000232523  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0172  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0373789 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000964949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000106014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000160535  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5717  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00280638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5655  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000792898  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0193  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000238459  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5047  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000895408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0611  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000107562  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5143  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000037642  normal  0.817541 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0074  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0536  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34797e-32 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0780  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.63949e-30 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0074  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0296  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000266549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0855  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000488484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5669  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0038  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000497098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0047  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000522107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0085  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000545364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0095  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000269172  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0048  tRNA-Gln  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000709091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4766  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101548  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4576  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.0809637 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0038  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258408  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0036  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0001  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.275531 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0052  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0041  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0033  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0041  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.794543  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0012  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12185  normal  0.483393 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0011  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0008  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.865665  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6012  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000169355  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2621  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0485041  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2222  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000059382  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2233  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181796  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t1806  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000098323  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2564  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>