51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_R0004 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_R0004  tRNA-Gln  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0004  tRNA-Gln  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164549  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0015  tRNA-Gln  89.47 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.060017  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0037  tRNA-Gln  90.79 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0036  tRNA-Gln  89.33 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000000427859  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0028  tRNA-Gln  88.16 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127569  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0036  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0005  tRNA-Gln  88.16 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4346  tRNA-Gln  86.67 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.850854  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0066  tRNA-Gln  86.67 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0081  tRNA-Gln  86.67 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000262166  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0033  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  54  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0012  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  54  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12185  normal  0.483393 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0016  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  54  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194756  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0021  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  54  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0591367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA16  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  54  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0012  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  54  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.376695  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0022  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  54  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0023  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  54  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0444305  normal  0.71139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0025  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0028  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4327  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  54  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4559  tRNA-Gln  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0037  tRNA-Gln  90.48 
 
 
72 bp  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0225857  normal  0.764291 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0048  tRNA-Gln  96.55 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000709091  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0018  tRNA-Gln  87.76 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.751418  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  86.89 
 
 
72 bp  50.1  0.00007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0011  tRNA-Gln  96.55 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.144781  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0025  tRNA-Gln  100 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0009  tRNA-Gln  96.3 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0018  tRNA-Gln  84 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000387356  hitchhiker  0.0000000187085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0016  tRNA-Gln  84 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160581  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0053  tRNA-Met  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307129  normal  0.0211178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0036  tRNA-Met  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.784357  normal  0.0160013 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0007  tRNA-Gln  84 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.791549  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0001  tRNA-Gln  84 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.275531 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0008  tRNA-Gln  84 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.970868  normal  0.737558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0035  tRNA-Met  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.906537  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0019  tRNA-Met  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0837222 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0515  tRNA-Gln  84 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0023  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0061  tRNA-Gln  84 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0203947  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0050  tRNA-Gln  84 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000077158  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0106  tRNA-Gln  84.85 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0058  tRNA-Gln  84.85 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0049  tRNA-Gln  84.85 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0010  tRNA-Gln  82.43 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277758  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0028  tRNA-Gln  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0008  tRNA-Gln  82.43 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.112331  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0008  tRNA-Gln  82.43 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.629298  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0046  tRNA-Gln  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0289454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>