85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_t41 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_t41  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.821705  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0018  tRNA-Gln  97.26 
 
 		 75 bp  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0047  tRNA-Gln  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0008  tRNA-Gln  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.825941  normal  0.0317691 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0048  tRNA-Gln  95.89 
 
 		 75 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.807187  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0014  tRNA-Gln  91.89 
 
 		 75 bp  99.6  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.349887  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0044  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126068 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0025  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0047  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.907945  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0005  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0004  tRNA-Gln  87.84 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0165875 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0018  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000387356  hitchhiker  0.0000000187085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0069  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476746  normal  0.206288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0022  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0064  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0011  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.144781  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0046  tRNA-Gln  88.71 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0074  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.181678 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0051  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0236  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0012758  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1924  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00590264  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0023  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0444305  normal  0.71139 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0012  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0021  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0591367 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0035  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.446482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0041  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0022  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0001  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.275531 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0017  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0046  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.53716e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0029  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4327  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0047  tRNA-Gln  87.1 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00177856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2529  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2621  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0485041  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2222  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000059382  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2233  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2307  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000654744  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2518  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0017354  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGlnVIMSS1309175  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0021  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0001  tRNA-Gln  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlnVIMSS1309214  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGlnVIMSS1309102  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGlnVIMSS1309134  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.500846  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0039  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.588412  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0028  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0037  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0036  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000000427859  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0028  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0025  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0004  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.40819e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4346  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.850854  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0017  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000337477  normal  0.142924 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0068  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0493446  normal  0.903824 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0081  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000262166  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0066  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0008  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.865665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0010  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277758  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0017  tRNA-Gln  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000220842  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0011  tRNA-Gln  85.71 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0032  tRNA-Gln  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000308987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna134  tRNA-Gln  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000841901  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0041    96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.693396  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0050  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000077158  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0036  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna137  tRNA-Gln  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000774984  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna139  tRNA-Gln  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000807662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna141  tRNA-Gln  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000824514  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna145  tRNA-Gln  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000913211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna150  tRNA-Gln  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000104181  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0061  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0203947  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0003  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01241  tRNA-Gln  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA36  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.881031  normal  0.0480599 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0037  tRNA-Gln  83.87 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0225857  normal  0.764291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0039  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0027  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.190933  normal  0.0646404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0056  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.309553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0012  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12185  normal  0.483393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0033  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0042  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01235  tRNA-Gln  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlnVIMSS1309367  tRNA-Gln  83.87 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>