83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_t0535 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_t0535  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Cys-2  tRNA-Cys  93.62 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0018  tRNA-Cys  91.07 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0070  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00415694  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0104  tRNA-Cys  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.916479  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0093  tRNA-Cys  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139562  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0030  tRNA-Cys  97.06 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000038111  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0037  tRNA-Cys  97.06 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000664876  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0040  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0040  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.578047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0087  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500213  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0613  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000112744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5719  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00287559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4764  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101548  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0538  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.435960000000001e-32 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0459686  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0650273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0128228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5684  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0257731  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0020  tRNA-Cys  91.11 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0214186 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.785195  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0007  tRNA-Cys  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0824294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0816  tRNA-Cys  85.94 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.713516  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1591  tRNA-Cys  94.44 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0177863  normal  0.766163 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000388055  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0051  tRNA-Cys  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0022  tRNA-Cys  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000266732  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0011  tRNA-Cys  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0024  tRNA-Cys  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0038  tRNA-Cys  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000123797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0032  tRNA-Cys  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0026  tRNA-Cys  87.27 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0056  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000403241  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0040  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0014  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000913003  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0042  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.815028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0052  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0037  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0008  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0027  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0017  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0205795  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0030  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.512325  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt53  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000393172 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0065  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000051222  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0013  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201212  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0020  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.979137  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0015  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000242975  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0004  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10265 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0042  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0029  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000761826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0037  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2454  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0026  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000374248  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0069  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0045  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.364336  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2153  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332579  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1864  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0091  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115005  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0059  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068081  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0050  tRNA-Cys  94.59 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000040729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2769  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0046  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.11041  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0028  tRNA-Cys  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0002  tRNA-Cys  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150631  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0018  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000387356  hitchhiker  0.0000000187085 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0037  tRNA-Cys  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.21352e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  87.23 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000224035  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0013  tRNA-Cys  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00140288  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0104  tRNA-Cys  87.23 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000263285  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11970  tRNA-Cys  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000107852  normal  0.103801 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0017  tRNA-Cys  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0019  tRNA-Cys  89.74 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0065  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0031  tRNA-Cys  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.392405  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0095  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224938  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0027  tRNA-Cys  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0027    93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583398  normal  0.0425769 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1223  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0426798  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0042  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.220787  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0027  tRNA-Cys  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.925736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>