31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_R24 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_R24  tRNA-Gln  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4327  tRNA-Gln  92.16 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0022  tRNA-Gln  92.16 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0023  tRNA-Gln  92.16 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0444305  normal  0.71139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0021  tRNA-Gln  92.16 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0591367 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4346  tRNA-Gln  90.2 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.850854  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0002  tRNA-Gln  92.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0018  tRNA-Gln  88.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000387356  hitchhiker  0.0000000187085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0069  tRNA-Gln  92.11 
 
 
75 bp  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476746  normal  0.206288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0022  tRNA-Gln  92.11 
 
 
75 bp  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598023  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0079  tRNA-Gln  94.12 
 
 
74 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0074  tRNA-Gln  92.11 
 
 
75 bp  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.181678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0064  tRNA-Gln  92.11 
 
 
75 bp  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0046  tRNA-Gln  90.24 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.11041  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0515  tRNA-Gln  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0025  tRNA-Gln  86.79 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0028  tRNA-Gln  86.79 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0007  tRNA-Gln  86.79 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.791549  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0008  tRNA-Gln  86.79 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.970868  normal  0.737558 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t06  tRNA-Gln  86.79 
 
 
72 bp  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  96.43 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0008  tRNA-Gln  90 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.865665  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6012  tRNA-Gln  91.43 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0052  tRNA-Gln  86.27 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00572206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0051  tRNA-Gln  86.27 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00516636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0048  tRNA-Gln  86.27 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0011  tRNA-Gln  91.43 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305007  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0022  tRNA-Gln  89.74 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.310652  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0041  tRNA-Gln  89.47 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0029  tRNA-Gln  89.47 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0001  tRNA-Gln  91.18 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.275531 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>