130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_R0015 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_R0015  tRNA-Gln  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.060017  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0037  tRNA-Gln  94.81 
 
 
76 bp  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0028  tRNA-Gln  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127569  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0036  tRNA-Gln  92.11 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000000427859  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0004  tRNA-Gln  89.47 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0004  tRNA-Gln  89.47 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164549  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0005  tRNA-Gln  90.91 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0025  tRNA-Gln  89.47 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0018  tRNA-Gln  89.47 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000387356  hitchhiker  0.0000000187085 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4327  tRNA-Gln  89.47 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4346  tRNA-Gln  89.47 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.850854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0028  tRNA-Gln  89.47 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0023  tRNA-Gln  89.47 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0444305  normal  0.71139 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0028  tRNA-Gln  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0066  tRNA-Gln  89.47 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0081  tRNA-Gln  89.47 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000262166  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0021  tRNA-Gln  89.47 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0591367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0022  tRNA-Gln  89.47 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0050  tRNA-Gln  88.16 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000077158  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0046  tRNA-Gln  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255383  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0037  tRNA-Gln  87.67 
 
 
72 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0225857  normal  0.764291 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0001  tRNA-Gln  86.84 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.275531 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0037  tRNA-Gln  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0515  tRNA-Gln  86.84 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0008  tRNA-Gln  86.84 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.970868  normal  0.737558 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0007  tRNA-Gln  86.84 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.791549  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0012  tRNA-Gln  86.84 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12185  normal  0.483393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0033  tRNA-Gln  86.84 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0036  tRNA-Gln  86.84 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA16  tRNA-Gln  91.3 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0016  tRNA-Gln  91.3 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194756  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t06  tRNA-Gln  86.3 
 
 
72 bp  58  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0046  tRNA-Gln  85.53 
 
 
75 bp  56  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.53716e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0012  tRNA-Gln  85.53 
 
 
75 bp  56  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.376695  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0014  tRNA-Gln  85.53 
 
 
75 bp  56  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.349887  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0026  tRNA-Gln  85.53 
 
 
75 bp  56  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327686  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0008  tRNA-Gln  89.13 
 
 
75 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.865665  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0018  tRNA-Gln  85.14 
 
 
75 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0052  tRNA-Gln  87.72 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0049  tRNA-Gln  85.51 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0047  tRNA-Gln  84.93 
 
 
72 bp  50.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4559  tRNA-Gln  84.21 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0106  tRNA-Gln  85.51 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0172  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0373789 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  87.5 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5652  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000646012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5661  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5682  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5689  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231453  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t18  tRNA-Gln  86.84 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  87.5 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  87.5 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  87.5 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000184976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  87.5 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000158624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  87.5 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000198835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  87.5 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0951866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  87.5 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.75916e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  87.5 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000252021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  87.5 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000616644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  87.5 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000069751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  87.5 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000190168  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA19  tRNA-Gln  86.84 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.488771  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R46  tRNA-Gln  86.84 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856686  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R75  tRNA-Gln  86.84 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0688488  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5143  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000037642  normal  0.817541 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000964949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000106014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000160535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0274  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0780  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.63949e-30 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0016  tRNA-Gln  84.21 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160581  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0536  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34797e-32 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0014  tRNA-Gln  86.84 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.474255  normal  0.24378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0015  tRNA-Gln  86.84 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365427  normal  0.400071 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0041  tRNA-Gln  87.5 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0074  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0029  tRNA-Gln  86.84 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0055  tRNA-Gln  86.84 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0041  tRNA-Gln  87.5 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.794543  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5319  tRNA-Gln  86.84 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11036  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0038  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000497098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0047  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000522107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0095  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000269172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4766  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101548  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0038  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0048  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000232523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0089  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0099  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157171  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0033  tRNA-Gln  86.84 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0067  tRNA-Gln  86.84 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963096  normal  0.0255259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0044  tRNA-Gln  86.84 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.275376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0070  tRNA-Gln  86.84 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374652  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4576  tRNA-Gln  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.0809637 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5727  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000826776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5717  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00280638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5669  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0193  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000238459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0296  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000266549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0611  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000107562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0855  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000488484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>