223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_R0017 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_R0017  tRNA-Gln  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000220842  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0047  tRNA-Gln  93.94 
 
 
75 bp  99.6  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.907945  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0419  tRNA-Gln  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0333429  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0012  tRNA-Gln  96.3 
 
 
75 bp  91.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0053  tRNA-Gln  90.79 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.203875  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0035  tRNA-Gln  91.18 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.446482  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0829  tRNA-Gln  89.33 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000799298  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0040  tRNA-Gln  89.47 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0578  tRNA-Gln  88 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.87866e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00011  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000114888  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00012  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000124601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0063  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.51209e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0064  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.7933e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0118  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119427  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0033  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000706309  hitchhiker  0.000775918 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0464  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.99671e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0795  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000207498  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0736  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000556049  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0722  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000907062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0127  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000119757  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0783  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000582426  normal  0.4419 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0782  tRNA-Gln  88 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000722917  normal  0.446267 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0077  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237072  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0119  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00174205  normal  0.184991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0126  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000102885  normal  0.191984 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4652  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.35384e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0117  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121705  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0830  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000784737  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5017  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0689  tRNA-Gln  88 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208898  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0690  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016844  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0157  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000220492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0126  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000574735  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0076  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268732  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0761  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000167269  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0760  tRNA-Gln  88 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000001352  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0063  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0160878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4651  tRNA-Gln  88 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.16576e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0123  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000509299  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0033  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000363695  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0721  tRNA-Gln  88 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000153053  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0794  tRNA-Gln  88 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000236079  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0735  tRNA-Gln  88 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000520956  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0032  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666816  hitchhiker  0.000769415 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5016  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0121  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.18894 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0149  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000775027  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0147  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000746626  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0151  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916325  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0109  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000000980988  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0110  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000374074  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0154  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000218199  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t012  tRNA-Gln  87.84 
 
 
75 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000011091  hitchhiker  0.000000000474372 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t011  tRNA-Gln  87.84 
 
 
75 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000894711  hitchhiker  0.000000000511472 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0001  tRNA-Gln  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.275531 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0004  tRNA-Gln  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.40819e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln01  tRNA-Gln  86.67 
 
 
78 bp  69.9  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017749  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln02  tRNA-Gln  86.67 
 
 
78 bp  69.9  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00912183  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0099  tRNA-Gln  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895438  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0132  tRNA-Gln  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000056335  normal  0.277016 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0094  tRNA-Gln  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300776  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0097  tRNA-Gln  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000737452  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0098  tRNA-Gln  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000673061  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0022  tRNA-Gln  90.74 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598023  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0014  tRNA-Gln  87.88 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.349887  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0069  tRNA-Gln  90.74 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476746  normal  0.206288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0074  tRNA-Gln  90.74 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.181678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0064  tRNA-Gln  90.74 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0168  tRNA-Gln  89.47 
 
 
72 bp  65.9  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0090  tRNA-Gln  86.11 
 
 
72 bp  63.9  0.000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.925974  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0008  tRNA-Gln  89.29 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.865665  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0072  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000124926  normal  0.0423905 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0053  tRNA-Gln  85.92 
 
 
72 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000068806  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0079  tRNA-Gln  86.67 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0127  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0027737  normal  0.534366 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0017  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000337477  normal  0.142924 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0018  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000387356  hitchhiker  0.0000000187085 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0129  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000954421  normal  0.381097 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0114  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000001247  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0074  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000739317  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0016  tRNA-Gln  85.92 
 
 
72 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363551  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0123  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00201303  hitchhiker  0.000458839 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0064  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0165002  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0001  tRNA-Gln  89.09 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0032  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000363695  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0070  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000111082  normal  0.043537 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0102  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0051  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0046  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000171717  normal  0.0156007 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0045  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000078833  normal  0.0156907 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0106  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000012042  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0103  tRNA-Gln  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0002  tRNA-Gln  90 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4327  tRNA-Gln  86.36 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0046  tRNA-Gln  86.36 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.53716e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t015  tRNA-Gln  85.14 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000513165  hitchhiker  0.000000000516486 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0023  tRNA-Gln  86.36 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0444305  normal  0.71139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0021  tRNA-Gln  86.36 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0591367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0022  tRNA-Gln  86.36 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal  0.0599368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>